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2024年第4期犬葡萄糖激酶调节蛋白的生物信息学分析17

犬葡萄糖激酶调节蛋白的生物信息学分析

刘迪瑄，袁鸣欣，肖鹏硕，刘蕊，刘博远，庞若玉，宋书峰，马学婧*

（沧州师范学院生命科学系，河北沧州061001）

摘要：试验旨在探讨犬葡萄糖激酶调节蛋白（glucokinaseregulatoryprotein，GCKR）的结构、功能及表达。

试验采用生物信息学方法对犬GCKR蛋白的理化性质、亲/疏水性、同源性和保守基序、信号肽和跨膜区、二级结

构、结构域、三级结构、磷酸化修饰、相互作用蛋白质和GO注释、亚细胞定位、基因结构、启动子和转录调控

进行了研究。结果显示：犬GCKR蛋白是一种不稳定酸性亲水蛋白质，与马的亲缘关系较近，没有信号肽和跨膜

区；二级结构由α-螺旋（47.36%）、延伸链（12.00%）、β-转角（4.48%）和无规则卷曲（36.16%）构成，含有2个

糖异构酶结构域；三级结构以马GCKR蛋白为模板构建且质量较高。犬GCKR蛋白含有28个磷酸化位点，其相互

作用蛋白包括葡萄糖激酶、酰胺水解酶结构域2、锌指蛋白512等，并参与糖代谢，主要定位于内质网；其基因具

有19个外显子和18个内含子，启动子位于第1302~1352bp，转录因子如Ncx、POU1F1a、C/EBPdelta可与启动子

结合。研究表明，犬GCKR蛋白可能参与犬糖尿病的发生机制，可作为研发相关药物的潜在靶标。

关键词：GCKR；犬；糖尿病；蛋白结构；蛋白表达；生物信息学

中图分类号：S829.3文献标识码：A文章编号：1672-9692（2024）04-0017-08

Doi：10.20154/ki.issn1672-9692.2024.04.004

Bioinformaticsanalysisofcanineglucokinaseregulatoryprotein

*

LiuDixuan,YuanMingxin,XiaoPengshuo,LiuRui,LiuBoyuan,PangRuoyu,SongShufeng,MaXuejing

(DepartmentofLifeSciences,CangzhouNormalUniversity,HebeiCangzhou061001)

Abstract:Thepurposeofthestudywastoinvestigatethestructure,functionandexpressionofcanineGCKRprotein.

Bioinformaticsmethodswereusedtostudythephysicochemicalproperties,hydrophilicity/hydrophobicity,homologyand

conservedmotif,signalpeptideandtransmembraneregion,secondarystructure,domain,tertiarystructure,phosphorylation

modification,interactingproteinandGOannotation,subcellularlocalization,genestructure,p