基于GEO数据库筛选胃癌诊断和预后的潜在基因及验证.pdfVIP

Jun.2025Vol.37No.6

2025年6月第37卷第6期

文章编号：1672-7134（2025）06-0627

中图分类号：R735.2文献标识码：BDOI：10.16448/j.cjtcm.2025.0627

基于GEO数据库筛选胃癌诊断和预后的潜在基因及验证*

王娟娟1褚明亮刘杰民23

，，

1贵州中医药大学研究生院贵州贵阳550025

2贵州中医药大学第一附属医院贵州贵阳550001

3贵州省人民医院贵州贵阳550002

摘要目的：基于数据库挖掘分析胃癌预后预测和胃癌靶向治疗的潜在关键基因。方法：从基因表达综合数据库

（GEO）获取人胃癌数据集GSE118916和GSE33651。通过在线工具GEO2R和仙桃在线数据平台绘制韦恩图并筛

选数据集重叠的差异表达基因（DEGs）。利用微生信在线数据分析平台对重叠DEGs进行基因本体（GO）和京都基

因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。通过STRING在线工具构建DEGs的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网

络，并使用Cytoscape筛选出排名前十的关键基因。使用基因表达谱交互式分析（GEPIA）数据库、人类蛋白质图谱

数据库、Kaplan-Meierplotter数据库和肿瘤免疫评估资源（TIMER）数据库进一步探索关键基因，并进行预后分析。

结果：GSE118916和GSE33651两数据集中有121个重叠DEGs，DEGs主要与细胞外基质受体互作通路和病灶黏附

通路等途径有关。经过PPI网络分析得到10个关键基因，使用GEPIA数据库、Kaplan-Meierplotter数据库和HPA

数据库进一步分析后，筛选出4个与胃癌预后相关的关键基因，它们分别是CD44、SPARC、COL1A1、FN1。这4个

基因在胃癌中高表达，且与胃癌患者的不良预后有关，TIMER数据库显示绝大部分关键基因与免疫浸润有关。结论：

CD44、SPARC、COL1A1、FN1可能是与胃癌发生发展的有关的关键基因，可能是胃癌诊断标志物和潜在治疗靶点。

关键词胃癌；生物标志物；生物信息学分析

ScreeningandValidationofPotentialGenesforGastricCancerDiagnosisandPrognosisbasedonGEo

Database

123

WANGJuanjuan,CHUMingliang,LIUJiemin

1.GuizhouUniversityofTraditionalChineseMedicine,GuizhouGuiyang550025,China

2.TheFirstAffiliatedHospitalofGuizhouUniversityofTraditionalChineseMedicine,GuizhouGuiyang550001,China

*基金项目：国家自然科学基金；贵州省高层次创新型人才项目（黔科合平台人才〔2020〕6016-2）；贵州省科技厅基金（黔科合J字

〔2015〕2086号）；贵州省高等学校工程研究中心项目（黔教技〔2023〕037号）

通信作者：褚明亮（1981-），男，主任技师，博士，硕士生导师。研究方向：中医药肿瘤防治的研究