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2025年第62卷第1期广西蚕业GuangxiSericultureVol.62No.1,2025
ISSN1006-1657;CN45-1213/S
DOI:10.19553/ki.1006-1657.2025.01.003
桂桑优12FLA13基因的克隆及其生物信息学分析
1,2,31,2,31,2,31,2,31,2,3
陆晓媚,邱长玉,刘丹,曾燕蓉,黄胜,
1,2,31,2,31,2,31,2,3*
何国玲,莫荣利,张朝华,林强
(1.广西壮族自治区蚕业技术推广站,南宁市530007;2.广西壮族自治区蚕业科学研究院,南宁市530007;
3.广西蚕桑遗传改良与高效种养重点实验室,南宁市530007)
摘要类成束阿拉伯半乳糖蛋白(FLAs)在植物中广泛存在,参与多种生命活动,对植物的生长发育和非生物胁迫
起到重要调控作用。以桂桑优12为材料,克隆出FLA13的全长编码区(CDS)序列,对其序列进行在线预测分析。结
果表明,桑树FLA13基因CDS区全长732bp,编码243个氨基酸残基,有1个开放性阅读框架。FLA13基因编码的蛋
白为酸性蛋白,属于不稳定蛋白,为亲水蛋白,含有FAS保守结构域,C端有GPI锚位点,N端有信号肽,无跨膜螺旋
结构,蛋白质包含有28个潜在的磷酸化位点,分析结果为进一步研究基因的功能提供了参考。
关键词桑树;FLA13;克隆;蛋白;生物信息学
中图分类号S888.2文献标识码A文章编号1006-1657-(2025)-01-0020-07
桑树(Morusspp.)是桑科、桑属多年生落叶乔木,心蛋白骨架的不同,AGPs分为经典AGPs和非经典
具有适应性强、栽培种类多、栽种范围广、寿命长等特AGPs[2]。前者的核心蛋白骨架通常由三部分组成:
点,是集果用、饲用、食用和药用为一体的经济作物,N端信号肽;长度不同的单个PAST中心结构域(富
具有显著的经济效益、社会效益和生态效益。类成含脯氨酸Pro、丙氨酸Ala、丝氨酸Ser和苏氨酸Thr残
[3]
束阿拉伯半乳糖蛋白(Fasciclin-likearabinogalactan基的区域);C端GPI锚定信号。一种经典AGPs的
proteins,FLAs)是阿拉伯半乳糖蛋白(arabinogalactanPAST区域被富集赖氨酸的区域分开,通常被称为赖
proteins,AGPs)的一个亚家族,在植物中广泛存在。氨酸富集的AGPs[4];另一种经典的AGPs,由于其成
AGPs是一类重要的糖蛋白,广泛存在于植物的细胞熟的蛋白骨架只有10~15个氨基酸,而被称为阿拉
壁、质膜和细胞外基质中,在细胞分化、增殖与生长、伯半乳糖多肽(AGpeptides)。还有许多具有保守结
细胞程序性死亡、花药发育、花粉管生长、合子分裂以构域的不同嵌合AGPs,可分为3个主要的亚家族,一
[1][5]
及胚胎发育等生物过程中发挥重要作用。AGPs是是类成束阿拉伯半乳糖蛋白(FLA),FLAs除具有
一类因结合的单糖和寡聚糖的排列模式和含量、蛋经典AGPs的核心蛋白骨架之外,还含有1~2个成束
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