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牦牛Akirin1基因克隆、生物信息学及组织表达分析.pdf

AGRICULTURAE华北农学报·2024，39（增刊）：267-273

BOREALI-SINICA

耗牛Akirinl基因克隆、生物信息学及组织表达分析

马荣²,路建卫3,赵

区雪扎老，成述儒”，喇永福2,

宪,梁春年12

吴晓云!？,包鹏甲,郭

1730070;

（1.中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所，甘肃省耗牛繁育工程重点实验室，甘肃兰州730050；2.甘肃农业大学，甘肃兰州

3.合作市农畜产品质量安全检测检验中心，甘肃合作747000；4.合作市佐盖多玛乡畜牧站，甘肃合作747000）

摘要：为探究耗牛Akirinl基因的序列特征，详细了解其组织表达特性。以甘南耗牛肌肉组织cDNA为模板，利用

RT-PCR技术克隆甘南耗牛Akirinl基因CDS序列,并使用多种生物在线软件及工具进行生物信息学分析，再利用qPCR

技术检测Akirinl基因在甘南耗牛心、肝、脾、肺、肾、肌肉、脂肪和睾丸组织中表达差异。结果显示,甘南耗牛Akirinl基因

CDS长579bp，共编码192个氨基酸，基因编码的蛋白分子式为C964His2sN27sO291Ss，蛋白理论等电点为8.91,不稳定系数

和总平均亲水性分别为84.14，-0.822,属于不稳定亲水性蛋白；蛋白潜在磷酸化位点有29个，分别为14个丝氨酸，11

个苏氨酸和4个酪氨酸；无信号肽和跨膜螺旋结构，亚细胞定位显示，主要存在于细胞核中，属于非分泌型蛋白；蛋白高

级结构主要由39.06%的α-螺旋和56.25%的无规则卷曲结构组成。同源性分析比对耗牛与普通牛亲缘关系最近，符合

实际情况，说明Akirinl基因在进化过程中相对具有一定保守性。实时荧光定量结果显示,Akirinl基因在成年甘南耗牛

心、肝、脾、肺、肾、肌肉和脂肪组织均有所表达，而在肾脏组织中相对表达最多，显著高于其他组织,在肌肉和肝脏组织中

表达相对较少。本试验为进一步研究耗牛Akirinl基因功能特征提供一定的理论基础。

关键词：耗牛；Akirinl基因；克隆；生物信息学分析；组织表达分析

中图分类号：S823；Q78文献标识码：A文章编号：1000-7091(2024）增刊-0267-07

doi:10.7668/hbnxb

Cloning,BioinformaticsandTissueExpressionProfile

AnalysisofAkirinlGeneinYak

MARong,LUJianwei,ZHAOXue,ZHALao,CHENGShuru,LAYongfu,

WUXiaoyun-2,BAOPengjia,CUOXian,LIANGChunnian.2

(1.LanzhouInstituteofAnimalHusbandryandVeterinaryMedicine,ChineseAcademyofAgriculturalSciences,

KeyLaboratoryofYakBreedingEngineeringinGansuProvince,Lanzhou730050,China;

2.GansuAgriculturalUniversity,Lanzhou730070,China;3.QualityandSafetyInspectionCenterof