基于转座子互作信息的piRNA预测算法构建及二化螟piRNA特征解析.docxVIP

基于转座子互作信息的piRNA预测算法构建及二化螟piRNA特征解析

一、引言

1.1piRNA研究背景

piRNA（Piwi-interactingRNA）作为一类非编码小RNA，于2006年被Aravin等和Girard等研究团队先后发现。当时，他们从小鼠的睾丸组织中提取总RNA并分离提纯，得到一组长度范围在26-31nt，大部分为29-30nt的小RNA，因其能与PIWI家族成员蛋白质结合形成核糖体蛋白复合体，故而被命名为piRNA。早期研究认为piRNA仅存在于果蝇、斑马鱼、小鼠以及大鼠的生殖系干细胞中，具有组织特异性，但后续研究发现，在雌性果蝇卵泡细胞、苍蝇头部、小鼠胰腺以及恒河猕猴附睾组织体细胞系等体细胞系中也存在piRNA或与piRNA相似的pilRNA，这极大地拓展了人们对piRNA分布的认知。

piRNA在生物体内发挥着诸多关键的生物学功能。在沉默转录基因方面，对果蝇和大鼠的研究提供了有力证据，表明piRNA参与其中，通过与特定的转录基因相互作用，抑制其转录过程，从而调控基因表达。在维持生殖系与干细胞功能上，piRNA起着不可或缺的作用。生殖细胞及干细胞的稳定对于生物的繁衍和个体发育至关重要，而转座子的异常转座可能会破坏基因组的稳定性，导致细胞功能紊乱。piRNA能够抑制转座子的转座