沙库巴曲缬沙坦对低氧性肺动脉高压大鼠肠道菌群影响的宏基因组学探究.docxVIP

沙库巴曲缬沙坦对低氧性肺动脉高压大鼠肠道菌群影响的宏基因组学探究

目录

一、内容概览．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1.1低氧性肺动脉高压概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

1.1.2肠道菌群与心血管疾病的关联性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

1.1.3沙库巴曲缬沙坦的药理作用简述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

1.2国内外研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

1.2.1低氧性肺动脉高压的肠道菌群研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

1.2.2沙库巴曲缬沙坦对肠道菌群的影响研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

1.3研究目的与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

1.3.1研究目的(研究目标)．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

1.3.2研究内容(研究内容)．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

二、材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

2.1实验动物与分组．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

2.1.1实验动物选取与饲养．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

2.1.2低氧性肺动脉高压模型建立．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

2.1.3实验分组与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

2.2样本采集与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

2.2.1粪便样本采集．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

2.2.2样本保存与运输．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

2.2.3总DNA提取与纯化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

2.3宏基因组测序与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

2.3.1宏基因组高通量测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

2.3.2数据质量控制与预处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41

2.3.3沙门氏菌样本区系分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42

2.3.4肠道菌群组成与丰度分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44

2.3.5差异菌群筛选与鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46

2.4统计学分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．48

2.4.1软件与工具．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．50

2.4.2统计分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．53

三、结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．56

3.1低氧性肺动脉高压模型的建立．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．57

3.1.1动物一般状况观察．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．59

3.1.2血压和右心室肥厚指标检测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．60

3.2沙库巴曲缬沙坦对低氧性肺动脉高压大鼠肠道菌群多样性的影响

3.2.1肠道菌群α多样性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．61

3.2.2肠道菌群β多样性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．63

3.3沙库巴曲缬沙坦对低氧性肺动脉高压大鼠肠道菌群组成的影响

3.3.1门水平菌群组成分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．67

3.3.2科水平菌群组成分析．．．．．．．．．