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板栗核黄素合成途径中关键基因的鉴定及其功能验证

目录

板栗核黄素合成途径中关键基因的鉴定及其功能验证（1）．．．．．．．．4

内容综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

1.2核黄素合成途径概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

1.3板栗特性及其营养价值．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

1.4研究目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

文献综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

2.1核黄素合成途径的分子机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

2.2关键酶基因的研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

2.3代谢工程在核黄素合成中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

2.4板栗基因资源与功能分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

实验材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

3.1实验材料与试剂．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

3.1.1板栗品种与培养条件．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

3.1.2主要试剂与设备．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

3.2实验方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

3.2.1板栗基因组DNA提取与测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45

3.2.2目标基因的鉴定与克隆．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46

3.2.3基因功能的生物信息学分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．50

3.2.4基因功能的体外验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．53

结果与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．55

4.1板栗基因组数据库构建与筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．55

4.2核黄素合成途径关键基因的鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．56

4.2.1基因序列比对与系统发育分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．57

4.2.2同源基因的保守结构域预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．58

4.3目标基因的表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．59

4.4基因功能验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．61

4.4.1过表达菌株的构建与筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．62

4.4.2核黄素含量测定与代谢产物分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．64

板栗核黄素合成途径中关键基因的鉴定及其功能验证（2）．．．．．．．66

内容概括．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．66

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．67

1.2核黄素代谢的基本概念．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．69

1.3研究目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．72

板栗核黄素合成途径的分子机制概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．74

2.1核黄素生物合成的基本过程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．75

2.2相关基因家族的系统分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．79

2.3途径中的关键调控节点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．80

关键候选基因的筛选与鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．81

3.1基因组数据库的构建与分析．．．．