- 1、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
- 4、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
- 5、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 6、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 7、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
.262.InfectInflammRep,Vol.25,No.4,December2024
论 著
··
DOI:10.3969/j.issn.1672-8521.2024.04.002
引用格式:姜一敏,蔡子涵,吴琼.对胆道闭锁诊断生物标志物及其与免疫细胞浸润关系的基于机器学习的分析[J].感染、炎症、修
复,2024,25(4):262-268.
对胆道闭锁诊断生物标志物及其与免疫细胞浸润关系的
基于机器学习的分析
姜一敏蔡子涵吴琼
(泗阳医院检验科,江苏泗阳223700)
【】
摘要目的:基于生物信息学技术筛选胆道闭锁的诊断生物标志物,分析其与免疫细胞浸润的相关性。方法:从基因
表达综合(GEO)数据库中获取与胆道闭锁相关的基因表达谱,利用R语言筛选与胆道闭锁相关的差异基因并进行基因的富
集分析。将差异基因与加权基因共表达网络选择的主要模块基因集合,通过使用LASSO回归和SVM-RFE分析两种机器学
习算法鉴定核心基因。采用受试者工作特征(ROC)曲线验证核心基因对胆道闭锁的诊断准确性。通过ssGSEA检测28种免
疫细胞的浸润水平及分析其与核心基因的联系。结果:共筛选出76个差异基因。富集分析显示,差异基因主要富集在细胞
外基质受体相互作用和白细胞介素()信号通路及磷脂酰肌醇激酶蛋白激酶()信号通路等。关键
-17IL-173-/BPI3K/Akt
模块和差异基因重叠后,筛选到26个重叠基因。通过SVM-RFE和Lasso这两种机器学习算法,确定3个核心基因(CXCL8、
、)作为胆道闭锁的可能诊断生物标志物。差异分析显示,、、在胆道闭锁患儿中表达
LAMC2KRT19CXCL8LAMC2KRT19
量显著高于正常对照者(P<)。曲线分析显示,、和具有较高的诊断价值,三者联合诊断
0.001ROCCXCL8LAMC2KRT19
的ROC曲线下面积为0.969,并且其与免疫细胞浸润呈正相关。结论:、和在胆道闭锁患儿的肝组织
CXCL8LAMC2KRT19
中均上调,联合诊断的准确性高,可能是胆道闭锁诊断的候选基因,这为后续治疗提供了新的思路。
【】
关键词胆道闭锁;机器学习;GEO数据库;生物信息学;诊断标志物
中图分类号:R575.6文献标识码:A
Machinelearning-base
初级会计持证人
专注于经营管理类文案的拟写、润色等,本人已有10余年相关工作经验,具有扎实的文案功底,尤善于各种框架类PPT文案,并收集有数百万份各层级、各领域规范类文件。欢迎大家咨询!
文档评论(0)