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福建农林大学学报(自然科学版)ｈｔｔｐｓ:∥ｊｆａｆｕ.ｆａｆｕ.ｅｄｕ.ｃｎ第５４卷第４期
ＪｏｕｒｎａｌｏｆＦｕｊｉａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅａｎｄＦｏｒｅｓｔｒｙＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ(ＮａｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅＥｄｉｔｉｏｎ)２０２５年７月
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引用格式:王一涵ꎬ张宏莉ꎬ张慧ꎬ等.红嘴鸥ＩＲＦ７基因克隆与生物信息学分析[Ｊ].福建农林大学学报(自然科学版)ꎬ２０２５ꎬ５４(４):５１３５２１.
ＷＡＮＧＹＨꎬＺＨＡＮＧＨＬꎬＺＨＡＮＧＨꎬｅｔａｌ.ＣｌｏｎｉｎｇａｎｄｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎａｌｙｓｉｓｏｆＩＲＦ７ｇｅｎｅｉｎＬａｒｕｓｒｉｄｉｂｕｎｄｕｓ[Ｊ].ＪｏｕｒｎａｌｏｆＦｕｊｉａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ
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ａｎｄＦｏｒｅｓｔｒｙＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ(ＮａｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅＥｄｉｔｉｏｎ)ꎬ２０２５ꎬ５４(４):５１３５２１.
红嘴鸥ＩＲＦ７基因克隆与生物信息学分析
王一涵ꎬ张宏莉ꎬ张慧ꎬ马俊蕊ꎬ项勋ꎬ段纲ꎬ常华
(云南农业大学动物医学院ꎬ云南昆明６５０２０１)
摘要:【目的】探究红嘴鸥(Ｌａｒｕｓｒｉｄｉｂｕｎｄｕｓ)干扰素调节因子７(ｉｎｔｅｒｆｅｒｏｎｒｅｇｕｌａｔｏｒｙｆａｃｔｏｒ７ꎬＩＲＦ７)基因的相关信息ꎬ为研究
ＩＲＦ７蛋白在抗病毒反应中的功能提供依据ꎮ【方法】克隆ＩＲＦ７基因ꎬ运用ＭｅｇＡｌｉｇｎ工具和ＭＥＧＡ１１.０软件分析其序列ꎬ运
用ＲａｒｅＣｏｄｏｎＣａｌｔｏｒ工具、ＰｒｏｔＰａｒａｍ工具、ＮｅｔＮＧｌｙｃ１.０工具、ＮｅｔＰｈｏｓ３.１工具、ＴＭＨＭＭ２.０工具、ＳｉｇｎａｌＰ４.１工具、
ＰｒｏｔＳｃａｌｅ工具、ＰＳＯＲＴＰｒｅｄｉｃｔｉｏｎ软件、ＳＯＰＭＡ和ＳＷＩＳＳ￣ＭＯＤＥＬ软件分析其编码蛋白的稀有密码子特征、理化性质、Ｎ￣糖
基化位点、磷酸化位点、跨膜区域、信号肽、亲水性、疏水性、亚细胞定位、二级结构和三级结构ꎮ【结果】红嘴鸥与三趾鸥
(Ｒｉｓｓａｔｒｉｄａｃｔｙｌａ)亲缘关系最近ꎬＩＲＦ７基因长度为１２４２ｂｐꎬＩＲＦ７是亲水性蛋白ꎬ不属于跨膜蛋白或分泌蛋白ꎬ其分子质量
约为４６ｋｕꎬ主要存在于细胞核ꎬ无信号肽和跨膜结构域ꎮＩＲＦ７二级结构主要由无规则卷曲构成ꎬ其三级结构与翻石鹬
(Ａｒｅｎａｒｉａｉｎｔｅｒｐｒｅｓ)ＩＲＦ７蛋白(模型蛋白)的相似性为７８.７３％ꎮ【结论】ＩＲＦ７基因的保守性较差ꎮ
关键词:红嘴鸥ꎻ干扰素调节因子７ꎻ克隆ꎻ生物信息学分析ꎻ病毒防御
中图分类号:Ｓ８５２
文献标识码:Ａ开放科学(资源服务)
文章编号:１６７１￣５４７０(２０２５)０４￣０５１３￣０９标识码(ＯＳＩＤ)
ＤＯＩ:１０.１３３２３/ｊ.ｃｎｋｉ.ｊ.ｆａｆｕ(ｎａｔ.ｓｃｉ.).２０２４０９０３５
ＣｌｏｎｉｎｇａｎｄｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎａｌｙｓｉｓｏｆＩＲＦ７ｇｅｎｅｉｎＬａｒｕｓｒｉｄｉｂｕｎｄｕｓ
ＷＡＮＧＹｉｈａｎꎬＺＨＡＮＧＨｏｎｇｌｉꎬＺＨＡＮＧＨｕｉꎬＭＡＪｕｎｒｕｉꎬＸＩＡＮＧＸｕｎꎬＤＵＡＮＧａｎｇꎬＣＨＡＮＧＨｕａ
(ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＶｅｔｅｒｉｎａｒｙＭｅｄｉｃｉｎｅꎬＹｕｎｎａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＫｕｎｍｉｎｇꎬＹｕｎｎａｎ６５０２０１ꎬＣｈｉｎａ)
Ａｂｓｔｒａｃｔ:【Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ】Ｔｈｉｓｓｔｕｄｙｆｏｃｕｓｅｄｏｎｔｈｅｒｅｌｅｖａｎｔｉｎｆｏｒｍａｔｉ
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