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小优细节君-HIF-1α老是空白条带,究竟为何?
很多刚接触HIF-1α的同学们很容易碰到一个问题,就是做的Western老是空白条带,什么都没有。今天我们就
带着这个问题,一起深入了解下这个缺氧大明星。
发现
美国癌症学家威廉·凯林(WilliamG.Kaelin,Jr.)
英国医学家彼得·拉特克利夫(SirPeterJ.Ratcliffe)
美国医学家格雷格·塞门扎(GreggL.Semenza)
HIF-1的发现得感谢上面三位科学家。我们一直知道氧气的重要性,却不清楚细胞是如何适应氧气水平的变化。
这三位科学家为大家揭示了细胞水平的分子机理以及核心蛋白HIF-1,从而获得诺贝尔生理学或医学奖。
简单描述下发现的过程:首先在缺氧情况下,发现细胞内的促红细胞生成素(Erythropoietin,EPO)会大量表达,
然后发现了增强EPO表达的关键区域——缺氧反应元件(HypoxiaResponseElement,HRE)。最后发现与HRE特异
性结合的蛋白——缺氧诱导因子(Hypoxia-InducibleFactor,HIF)。
结构
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HIF-1结构上是一个异源二聚体,其中一个命名为HIF-1α,另外一个,命名为HIF-1β。HIF-1β又叫芳香烃受体
核转运因子(ArylHydrocarbonReceptorNuclearTranslocator,ARNT)。研究发现,HIF-1β对氧气含量的变化并不
敏感,所以我们的主角就是HIF-1α了。
HIF家族结构域示意图
HIF家族有共同的两个结构域:一个是紫色部分的碱性螺旋-环-螺旋结构域(BasicHelix-Loop-Helix,bHLH),一
个是绿色部分的Per-ARNT-Sim结构域(Periodicity-ARNT-Single-minded,PAS)。这两个结构域是HIF-1α和
HIF-1β亚基形成异二聚体所必需的。
蓝色是氧依赖降解结构域(Oxygen-DependentDegradation,ODD),是HIF1受氧调控的关键部位,这个我们
下部分细讲。N-TAD和C-TAD是两个反式激活结构域(transactivationdomain,TAD),N-TAD位于ODD结构域,
C-TAD可以和CBP/p300等相互作用共同激活下游基因。这两个结构域共同负责HIF-1α转录活性。
HIF-2α在HIF-1α被发现不久后就被克隆出来了。HIF-2α与HIF-1α有48%的氨基酸序列是相同的,功能也类
似,可以与HIF-1β形成异二聚体并结合HRE。不过与HIF-1α的普遍表达不同的是,HIF-2α主要表达在肺,内皮,颈
动脉中。
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后来发现的HIF-3α也在多种组织中表达,同样与HIF-1β形成异二聚体并结合HRE。不过目前HIF-1α和HIF-2
α研究更加广泛,而HIF-3α和其他HIF亚型研究较少,还有待大家去研究。
降解
为什么HIF-1αWestern难做呢,主要就是因为常氧快速降解,还没等你检测,就已经没有了。
HIF-1α信号通路
我们一起来看上面的通路图,在常氧条件下,HIF-1α会发生脯氨酸羟基化(402和564位点都是脯氨酸),细
心的同学还可以看到图中K532也同时发生了乙酰化。这时冯·希佩尔-林道肿瘤抑制蛋白(vonHippel-Lindautumor
suppressorp
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