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微生物组对CRC表观遗传的影响

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第一部分微生物组代谢产物的表观遗传效应2

第二部分短链脂肪酸对组蛋白乙酰化的控4

第三部分微生物群失引起的DMA甲基化改变8

第四部分细菌产物对染色质可及性的影响10

第五部分微生物组与非编码RNA表达控12

第六部分肠道菌群介导的组蛋白修饰改变14

第七部分微生物来源的表观遗传节剂16

第八部分微生物组对CRC表观遗传治疗的潜在影响18

第一部分微生物组代谢产物的表观遗传效应

微生物组代谢产物的表观遗传效应

简介

微生物组通过其代谢活动产生广泛的产物，这些产物可以影响宿主的

表观遗传机制。表观遗传修饰是可遗传的分子改变，不改变DNA序列,

但可以影响基因表达。微生物组代谢产物通过多种途径控表观遗传

修饰，包括：

影响组蛋白修饰

微生物组代谢产物可以通过影响组蛋白修饰酶的活性来改变组蛋白

修饰状态。例如，丁酸盐是一种由肠道细菌产生的短链脂肪酸，可以

抑制组蛋白去乙酰化酶(HDAC),导致组蛋白乙酰化增加，从而促进

基因转录。

控DNA甲基化

微生物组代谢产物还可以影响DNA甲基化，这是表观遗传控的另一

个关键机制。例如，S-腺甘蛋氨酸(SAMe)是由肠道细菌产生的辅因

子，可以作为DNA甲基转移酶(DNMT)的甲基供体。SAMe水平的增

加与DNA甲基化增加相关，从而抑制基因表达。

miRNA控

微生物组代谢产物还可以控microRNA(miRNA)的表达。miRNA是

非编码RNA分子，可以靶向mRNA并抑制其翻译。某些微生物组代

谢产物，如酪氨酸衍生的代谢物，可以影响miRNA的表达，从而影

响基因表达。

影响表观遗传修饰的具体代谢产物

已发现多种微生物组代谢产物具有表观遗传效应，包括：

*短链脂肪酸S（CFAs）：如丁酸盐、丙酸盐和丁酸盐，可以抑制HDAC,

促进基因转录。

*三甲胺N氧化物T（MAO）：由肠道细菌产生的代谢产物，与DNA

甲基化增加相关。

*S-腺普蛋氨酸S（AMe）：一种辅因子，可以作为DNMT的甲基供体，

促进DNA甲基化。

*胆汁酸代谢产物：如异去氧胆酸，可以激活DNA甲基化酶。

*酪氨酸衍生物：如酪氨酸衍生代谢物，可以抑制miRNA表达。

表观遗传效应的机制

微生物组代谢产物通过多种机制发挥其表观遗传效应，包括：

*直接相互作用：代谢产物可以直接与表观遗传修饰酶或DNA结合,

影响它们的活性。

*信号转导通路：代谢产物可以触发信号转导通路，导致表观遗传修

饰酶的激活或抑制。

*营养节：代谢产物可以提供或消耗表观遗传修饰酶所需的营养因

子。

*代谢重编程：代谢产物可以改变宿主的代谢途径，从而影响表观遗

传修饰所需的底物和辅因子。

疾病影响

微生物组代谢产物的表观遗传效应与多种疾病相关，包括：

*结直肠癌(CRC)：丁酸盐等SCFAs已被证明可以抑制CRC细胞

增殖和诱导细胞分化。

*炎症性肠病(IBD)：TMAO等代谢产物与IBD的严重程度增加相

关。

*心血管疾病(CVD)：胆汁酸代谢产物与CVD风险增加相关。

*代谢综合征：SAMe水平与肥胖和胰岛素抵抗相关。

结论

微生物组代谢产物通过影响表观遗传修饰，在宿主健康和疾病中发挥

重要作用。了解这些表观遗传效应对于开发基于微生物组的治疗策略

至关重要，以改善人类健康。

第二部分短链脂酸对组蛋白乙酰化的调控