药物发现：基于机器学习的药物筛选_6.计算化学与分子建模.docx

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6.计算化学与分子建模

6.1分子表示与特征提取

在药物发现领域，分子表示和特征提取是计算化学与分子建模的基础。通过将分子转化为计算机可以处理的形式，我们可以利用机器学习算法进行高效的药物筛选。常见的分子表示方法包括分子指纹、分子图、三维结构表示等。

6.1.1分子指纹

分子指纹是一种将分子结构转化为二进制或整数向量的方法，这些向量可以用来表示分子的化学特性。常见的分子指纹有Morgan指纹、MACCS指纹等。这些指纹可以在不同的尺度上捕捉分子的局部和全局特征，从而用于相似性搜索和分类任务。

代码示例：使用RDKit生成Morgan指