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比较基因组与分子进化第1页，共28页，星期日，2025年，2月5日分子进化除RNA病毒外,几乎所有生命的蓝图都用DNA书写，进化的第一原因是基因突变。分子进化：原始生命产生之后，生物大分子结构变化以及这些变化和生物进化的关系。第2页，共28页，星期日，2025年，2月5日Humanfishβ-globin氨基酸差异数/氨基酸总座位数/两物种分歧时间/2一、分子进化速率指蛋白质和核酸等生物大分子在进化过程中核苷酸或氨基酸残基发生替换的频率。第3页，共28页，星期日，2025年，2月5日分子进化的速率约为10-9，每年每个氨基酸座位的1×10-9进化速率为分子进化速率的单位，即1×10-9为1鲍林。蛋白质Kaa/10-9细胞色素C0.3血红蛋白α1.2血纤蛋白肽8.3溶菌酶2.0第4页，共28页，星期日，2025年，2月5日1.分子进化速率具有恒定性对于各种生物物种的每一个蛋白质，用每一个位点每年发生的氨基酸替换的次数为标准衡量分子进化的速率是大致恒定的，只要该分子的功能和三维结构保持不变；二、分子进化的特点第5页，共28页，星期日，2025年，2月5日2.分子进化的保守性不同对生物生存制约性大的生物大分子进化速度慢。生物大分子内部功能区结构变化的速度较慢,而且功能越重要的区域变化速度越慢。人类不同的Ig家族的V.D.J.C基因数家族VJCLλ300766Lκ30051H～30049VJC第6页，共28页，星期日，2025年，2月5日1.大多数无害突变基因在选择上是中性的,并不

影响个体的适合度。三、分子进化的中性理论第7页，共28页，星期日，2025年，2月5日2.中性基因在群体中的固定主要是由随机

遗传漂变引起的。遗传漂变（geneticdrift）：由于某种随机因素，某一等位基因的频率在群体中出现世代传递的波动现象称为遗传漂变。第8页，共28页，星期日，2025年，2月5日3.新基因主要是通过基因重复后再突变

而产生的第9页，共28页，星期日，2025年，2月5日四、PCR技术在古分子系统学中的应用从17-20Ma前的叶化石中分离出了叶绿体Rubisco基因大亚基的片段。从25Ma-1.35亿年前的琥珀中的蜂、白蚁、象鼻虫的遗体中分离出基因片段。第10页，共28页，星期日，2025年，2月5日HomosapiensCanislupusfamiliarisMolecularClockEstimatesHuman-dogsplit~83MYA五、分子钟第11页，共28页，星期日，2025年，2月5日确定生物大分子和物种由古生物学确定各物种分岐时间比较各物种之间该种生物大分子间的差异六、系统发生树第12页，共28页，星期日，2025年，2月5日比较基因组学比较不同物种的整个基因组，可以深入理解每个基因组的功能和进化关系。基因组是一切生命的真谛。第13页，共28页，星期日，2025年，2月5日1985发起1988.美国能源部与国家医学研究院30亿美元1990.正式启动.1998.Celera公司宣布一项提前完成基因组测序的3年计划2001年2月同时在Nature和Science发表一、人类基因组计划(Humangenomeproject,HGP)第14页，共28页，星期日，2025年，2月5日绘制24条染色体的物理图谱鉴定每一条染色体的基因并作图完成30亿碱基对的序列测定分析人类的遗传变异对模式生物基因组绘图及测序开发与之相关的实验技术及计算机程序解析基因组的信息探讨与这些研究相关的伦理、法律、社会问题第15页，共28页，星期日，2025年，2月5日5个人的DNA2男,3女2个白种人,1个亚洲人,

1个非洲人,1个西班牙人。人类基因组测序DNA样本：第16页，共28页，星期日，2025年，2月5日1、大肠杆菌(Escherichiacoli)2、酵母(Saccharomycescerevisiae)3、拟南芥(Arabidops