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2025,54(1):1～10.
SubtropicalPlantScience
蕈树KNOX基因家族鉴定及组织表达分析
1,21,345111*
王安邦，叶兴状，赵金涛，陈志云，翁慧莹，林茂，张国防
(1.福建农林大学林学院，福建福州350002；2.福建农林大学生命科学学院，福建福州350002；3.福建省亚热带植物研究所，福
建厦门361006；4.福建农林大学菌草与生态学院(碳中和学院)，福建福州350002；5.福建省邵武卫闽国有林场，福建南平354000)
摘要：KNOX基因家族在植物叶形生长发育方面具有重要调节功能。为鉴定并分析蕈树Altingiachinensis的KNOX
基因家族，探寻其组织表达模式，借助生物信息学方法，在蕈树全基因组水平鉴定KNOX基因家族，并对其基因位置、
基因结构、系统进化关系、基因共线性以及转录组表达进行分析。从蕈树基因组中8条染色体上得到11个AcKNOXs，
其中AcKNOX6和AcKNOX9无ELK和HomeoboxKN结构域，AcKNOX7无ELK结构域，其余均有完整结构域。蕈树
AcKNOXs分为ClassⅠ(AcKNOX1、AcKNOX2、AcKNOX5、AcKNOX8、AcKNOX10、AcKNOX11)、ClassⅡ(AcKNOX3、
AcKNOX4、AcKNOX7)和ClassM(AcKNOX6、AcKNOX9)三类。AcKNOXs蛋白包含144～444个氨基酸，亚细胞定位均
位于细胞核，均为酸性不稳定亲水蛋白。表达模式分析表明，AcKNOXs基因存在组织特异性，但同一亚家族大部分成
员的表达模式相似。鉴定的11个AcKNOX成员扩增方式为片段复制，无串联重复。AcKNOX3/AcKNOX4、
KNOX2/AcKNOX8、AcKNOX6/AcKNOX9、AcKNOX5/AcKNOX10共4对基因间存在共线性关系。该研究结果为进一步研
究蕈树KNOX基因家族基因组特性提供科学依据。
关键词：蕈树；KNOX基因家族；生物信息学；系统发育分析；表达分析
Doi:10.3969/j.issn.1009-7791.2025.01.001
中图分类号：S792文献标识码：A文章编号：1009-7791(2025)01-0001-10
Genome-wideIdentificationandTissueExpressionAnalysisoftheKNOX
GeneFamilyinAltingiachinensis
1,21,34511
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