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分子植物育种,2025年,第23卷,第13期,第4296-4307页
MolecularPlantBreeding,2025,Vol.23,No.13,4296-4307
研究报告
ResearchReport
普通烟草CBL基因家族全基因组鉴定与分析
曾文艺周思如左同鸿刘义梅朱利泉李勇徐小洪1111122*
1西南大学农学与生物科技学院,重庆,400715;2中国烟草总公司重庆市公司烟草科学研究所,重庆,400715
*通信作者,xuxh3@
2+
摘要CBL基因家族是Ca介导植物信号转导途径中的一个重要家族,在植物逆境胁迫响应、植株生长
发育中起着关键作用,但烟草CBL基因家族缺乏系统性报道。本研究通过生物信息学系统地分析了烟草
CBL基因家族成员的蛋白理化性质、染色体定位、系统发育进化、基因结构、保守结构域、共线性、顺式作用
元件和组织表达模式;结果表明:在普通烟草基因组鉴定出20个烟草CBL基因家族成员,分为3个亚族,分
别命名为GroupA、GroupB以及GroupC,家族成员不均匀地分布在各条染色体上;CBL蛋白编码的氨基酸
数为164~331aa;相对分子质量在19.22~37.23kD之间;理论等电点(pI)在4.55~5.31之间,可见NtCBLs蛋
白基本呈现酸性蛋白。基因结构分析表明NtCBLs除NtCBL5以外均包含内含子和外显子,内含子介于7~9
之间,预测的家族成员中均存在EF-hand结构域,鉴定出6个motif。进化分析发现CBL基因家族可分为3个
类群,整个家族中存在7个基因复制对,并且与拟南芥的CBL家族中的5个基因存在共线性。烟草CBL基
因家族上游1500bp启动子序列里面存在多种类型的非生物胁迫响应顺式作用元件,成员间顺式作用元件
的类型和数量存在差异,预测烟草CBL基因家族在植株抗逆中可能发挥作用。结合烟草表达数据库分析发
现,部分家族成员如GroupB亚族在组织表达特性有所差异,在花中表达量较高。研究结果首次鉴定并初步
分析了烟草CBL基因家族成员,这为深入研究烟草CBL基因家族功能提供理论基础。
关键词基因家族;CBL;烟草;生物信息
Genome-wideIdentificationandAnalysisofCBLFamilyGenesinTobacco
ZengWenyiZhouSiruZuoTonghongLiuYimeiZhuLiquanLiYongXuXiaohong1111122*
1SchoolofAgronomyandBiotechnology,SouthwestUniversity,Chongqing,400715;2TobaccoScienceResearchInstituteofChongqingTobacco
Company,Chongqing,400715
*Correspondingauthor,xuxh3@
DOI:10.13271/j.mpb.023.004296
2+
AbstractTheCBLgenefamilyisanimportantfamilyintheCa-mediatedplantsignaltransductionpathway,
whichplaysakeyroleinplantstressresponseandplantgrowthanddevelopment,butthetobaccoCBLgene
familylackssystematicreports.Thisstudysystematicallyanalyzedtheproteinphysicochemicalproperties,chro-
mosomallocation,phylogeneticevolution,genestructure,conserveddomains,collinearity,-actingelements,
cis
andtissueexpressionpatternsoftobaccoCBLgenefamilymembersthroughbioinformatics;theresultsshowed:
T
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