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2025,38(4):42-52林业科学研究
/lykxyj/ForestResearch
DOI:10.12403/j.1001-1498
巨桉CLE基因家族鉴定及表达分析
12232*
李靖思,陆钊华,杨德明,秦健,李光友
(1.柳州市都乐公园管理处,广西柳州545005;2.中国林业科学研究院热带林业研究所,国家林业和草原局热带林业重点实验室,
广东广州510520;3.广东省农业科学院果树研究所,农业农村部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室,
广东省果树科学与技术研究重点实验室,广东广州,510640)
摘要:[目的]鉴定巨桉CLE短肽家族成员,解析EgCLE基因在不同组织部位、激素处理和胁迫响应的表达
模式,进而深入了解其在巨桉生长发育中的作用。[方法]通过生物信息学方法对巨桉CLE基因家族成员进行
全基因组鉴定,并对其理化性质、染色体定位、进化与基因结构、蛋白保守结构域、启动子元件和表达模式进
行分析。[结果]从巨桉基因组中共鉴定出13个EgCLE基因,不均匀分布在6条染色体上。从13个
EgCLE基因中分离出12种十二氨基酸CLE肽,其中9个A型CLE肽,2个B型CLE肽,1个未知类型
CLE肽。EgCLE基因编码83~140个氨基酸,绝大部分为酸性疏水性蛋白且均不稳定。大部分EgCLE基因为
单外显子结构,且motif1在EgCLE家族中非常保守。顺式作用元件分析发现EgCLE家族成员启动子区域中
包含多个生长发育、激素应答与胁迫响应元件。表达分析显示大多数EgCLE基因存在组织特异性表达模式。
EgCLE基因对SA处理不敏感,而JA处理对EgCLE基因的表达量影响较大。部分EgCLE基因如
EgCLE16、EgCLE27响应盐胁迫与营养胁迫。[结论]巨桉CLE基因家族成员在巨桉器官发育中起着重要的
调控作用,EgCLE作为重要的短肽信号分子作用于巨桉的初生与次生生长、非生物胁迫响应等生物学过程,
研究结果为后续解析EgCLE基因调控巨桉生长发育的分子机制提供理论基础。
关键词:巨桉;短肽信号;CLE;基因家族;表达模式
中图分类号:S723.9文献标识码:A文章编号:1001-1498(2025)04-0042-11
植物信号肽是重要的胞间信号感应分子,在细胞CLE肽的功能核心,去除CLEmotif上游序列或被
间通信、生长发育和胁迫响应等生物过程中发挥重不相关的序列取代,其编码的融合蛋白仍具有完全
[1-2][10-11]
要作用。目前在植物中已鉴定到一些类激素信生物活性,因此,利用合成CLE肽外源处理
[12-13]
号肽,如CLAVATA3/EMBRYOSURROUNDING可表现出类似于对应CLE基因过表达的表型。
REGION(CLE)、系统素(HypSys)、快速碱化CLE根据在植物器官形成过程中的功能分
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