计算机在生物学中的应用.ppt

七细胞计划1虚拟细胞构建虚拟细胞（virtualcell）又称电子细胞（e-cell）。它是应用信息科学的原理和技术，通过数学的计算和分析，对细胞的结构和功能进行分析、整合和应用，以模拟和再现细胞和生命的工作。1)京都基因和基因组大百科全书（KEGG计划）基于图15的观点，KEGG以分子和基因为元素，分子的相互作用、遗传相互作用和其他的分子或基因的关系为二元关系，构成网络。第157页，共183页，星期日，2025年，2月5日KEGG的目标在于提供一个包括所有已知生化网络的完善的参考数据库，用于基于知识的预测。其提供各种各样的计算工具来搜索和比较存储在数据库中的不同类型的网络。其中层级树网络是总结相似性关系知识的便捷方式。其对解释复杂的生物关系作用有限，但能近似地抓住生物关系最重要的特征（例图15）。而网络预测（生物体重建）是计算的挑战问题。KEGG：www.genome.ad.jp/kegg/检索工具(DBGET)说明：www.genome.ad.jp/dbget/dbget_manual.html第158页，共183页，星期日，2025年，2月5日2)虚拟细胞的模型：A日本虚拟细胞模型：由代谢组、生物信息学和基因工程中心组成研究机构，以细菌糖代谢过程为主要内容，选取12