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基因数据解读师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
主流二代测序(NGS)技术的核心原理是?
A.单分子实时测序(PacBioSMRT)
B.边合成边测序(Illumina)
C.纳米孔电信号测序(OxfordNanopore)
D.双脱氧链终止法(Sanger)
答案:B
解析:二代测序(NGS)的主流技术是Illumina的边合成边测序(SequencingbySynthesis),通过桥式PCR扩增和荧光标记脱氧核苷酸实现大规模平行测序。A为三代测序技术,C为三代纳米孔测序技术,D为一代Sanger测序原理,均不符合NGS核心原理。
以下哪种变异类型属于小变异(SmallVariant)?
A.拷贝数变异(CNV)
B.染色体易位(Translocation)
C.单核苷酸变异(SNV)
D.插入缺失(Indel)长度50bp
答案:C
解析:小变异通常指长度≤50bp的变异,包括SNV(单核苷酸变异)和短Indel(插入缺失)。A(CNV)和B(染色体易位)属于结构变异,D(Indel50bp)属于大Indel,均不属于小变异范畴。
以下哪个数据库主要用于存储人群频率变异数据?
A.ClinVar
B.dbSNP
C.HGMD
D.gnomAD
答案:D
解析:gnomAD(基因组聚集数据库)专注于健康人群的变异频率数据,是基因解读中评估变异稀有性的核心数据库。A(ClinVar)存储临床致病性数据,B(dbSNP)是通用变异位点数据库(包含致病性和非致病性),C(HGMD)是人类孟德尔遗传病数据库(聚焦致病突变),均不符合“人群频率”的核心功能。
NGS数据质量控制中,Q30表示?
A.测序错误率≤0.1%的碱基比例
B.测序错误率≤1%的碱基比例
C.测序深度≥30×的区域比例
D.比对到参考基因组的reads比例
答案:A
解析:Q值(Phred质量分数)与错误率的关系为Q=-10×log??(错误率)。Q30对应错误率=10^(-3)=0.1%,因此Q30表示错误率≤0.1%的碱基占比。B对应Q20(错误率1%),C为测序深度指标,D为比对率指标,均错误。
以下哪个工具常用于基因变异的功能注释?
A.GATK
B.ANNOVAR
C.BWA
D.Samtools
答案:B
解析:ANNOVAR(AnnotationVariants)是经典的变异注释工具,可注释变异的功能影响(如错义突变、剪接位点)、人群频率、数据库关联等。A(GATK)用于变异检测,C(BWA)用于序列比对,D(Samtools)用于SAM/BAM文件操作,均非注释工具。
连锁不平衡(LD)系数r2的取值范围是?
A.0~1
B.-1~1
C.0~∞
D.-∞~∞
答案:A
解析:连锁不平衡系数r2反映两个位点等位基因关联程度,取值范围为0(完全独立)到1(完全连锁),无负值。B为相关系数r的范围,C、D不符合LD定义。
外显率(Penetrance)是指?
A.携带致病变异的个体表现出临床症状的比例
B.变异在人群中的发生频率
C.变异对蛋白质功能的影响程度
D.基因表达产物的数量
答案:A
解析:外显率指携带特定致病变异的个体实际表现出相应表型的比例(如BRCA1突变携带者中患乳腺癌的比例)。B为频率,C为功能影响(如致病性),D为表达量,均错误。
以下哪种技术更适合检测拷贝数变异(CNV)?
A.全外显子测序(WES)
B.定量PCR(qPCR)
C.Sanger测序
D.一代基因芯片(微阵列)
答案:D
解析:基因芯片(如aCGH)通过探针信号强度差异可高效检测CNV,是临床CNV检测的金标准之一。WES对CNV检测敏感性较低(仅覆盖外显子区域),qPCR适合小范围CNV验证,Sanger无法检测CNV,故D正确。
全基因组关联分析(GWAS)中常用的统计方法是?
A.卡方检验
B.线性回归
C.逻辑回归
Cochrran-Armitage趋势检验
答案:C
解析:GWAS通常分析病例-对照研究,逻辑回归(LogisticRegression)用于二分类变量(患病/未患病)的关联分析,是主流方法。A(卡方检验)用于频数比较,B(线性回归)用于连续变量,D(趋势检验)是逻辑回归的简化形式,均非最常用。
孟德尔遗传定律适用于以下哪种变异?
A.线粒体DNA变异
B.体细胞变异
C.常染色体显性变异
D.表观遗传修饰
答案:C
解析:孟德尔定律描述核基因的分离与自由组合,适用于常染色体显性/隐性、X连锁等单基因遗传模式。A(线粒体遗传为母系遗传)、B(体细胞变异不遗传)、D(表观修饰不改变DNA序列)均不遵循孟德尔定律。
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