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基于分子标记技术解析蓝莓及其近缘种的遗传密码与亲缘纽带

一、引言

1.1蓝莓研究背景与意义

蓝莓（Vacciniumspp.），属杜鹃花科越橘属，多年生落叶或常绿灌木，是一种具有极高经济价值的新兴世界性小浆果树种。其果实不仅味道酸甜可口，香气清爽宜人，而且富含多种对人体有益的成分。除了常规的糖、酸和维生素C外，蓝莓还富含维生素E、维生素A、维生素B、超氧化物歧化酶（SOD）、熊果苷、蛋白质、花青苷、食用纤维以及丰富的钾、铁、锌、钙等矿质元素。这些营养成分赋予了蓝莓多种保健功效，如改善循环、抗炎症、提高免疫力等，因此蓝莓已被国际粮农组织列为人类五大健康食品之一。

近年来，随着人们健康饮食观念的提升，蓝莓在全球范围内的市场需求持续增长。为满足这一需求，全球蓝莓种植面积和产量不断攀升。2021年，全球蓝莓种植面积达到235,408.00公顷，总产量达1,934.40千吨，其中高丛蓝莓产量远高于野生蓝莓产量。中国蓝莓产业发展迅速，2020年，中国蓝莓种植面积和总产量超越美国，跃居全球第一位。2024年，我国蓝莓栽培面积143.82万亩，总产量78万吨，栽培面积和产量均实现了显著增长。

然而，在蓝莓产业蓬勃发展的背后，也存在一些问题。例如，由于早期以加工鲜果为目标的蓝莓种植面积较多，以及栽培管理不善等原因，导致中国蓝莓鲜果的产量仅排在全球第三位，鲜果占总产量的比例仅为46.15%，远低于世界平均70%左右的水平，更低于南美等国家90%以上的水平。此外，中国蓝莓生产中同名异物或同物异名的现象比较普遍，对引进品种的遗传背景及品种间的亲缘关系缺乏了解，制约了蓝莓育种工作的系统性开展。因此，深入开展蓝莓及其近缘种的研究，开发有效的分子标记技术，明确其亲缘关系，对于蓝莓种质资源的保存、评价及科学利用具有重要意义，有助于选育出更优质的蓝莓品种，提高蓝莓的品质和产量，推动蓝莓产业的可持续发展。

1.2分子标记技术概述

分子标记技术是以DNA多态性为基础的遗传标记技术，自问世以来，在植物研究领域得到了广泛应用。与传统的形态标记、细胞学标记和生化标记相比，分子标记具有诸多优势，如遗传稳定、标记数量丰富、不影响目标性状表达、多态性高、选择响应高等。常见的分子标记技术包括简单序列重复（SSR）、相关序列扩增多态性（SRAP）、随机扩增多态性DNA（RAPD）、扩增片段长度多态性（AFLP）、简单重复序列间扩增（ISSR）等。

SSR标记，又称微卫星DNA标记，是一类由1-6个核苷酸组成的基序串联重复而成的DNA序列，其重复次数在不同个体间具有高度变异性，从而产生多态性。SSR标记具有多态性高、共显性遗传、重复性好、操作简便等特点，在植物遗传多样性分析、亲缘关系鉴定、遗传图谱构建、品种鉴定等方面应用广泛。例如，在蓝莓研究中，Boches等使用了20个EST-SSR和8个基因组SSRs，成功分析了69种VacciniumcorymbosumL.的遗传多样性，包括13个野生品种和56个栽培种。

SRAP标记是一种基于PCR技术的新型分子标记，它通过设计独特的引物对基因的编码区和启动子、内含子等非编码区进行扩增，从而产生多态性。SRAP标记具有操作简单、多态性丰富、引物通用性强、成本较低等优点，在植物遗传多样性分析、种质鉴定、基因定位等方面发挥了重要作用。在蓝莓品种的SRAP遗传多样性分析及品种鉴别研究中，采用15对SRAP引物对21个蓝莓栽培品种进行分析，共获得207条带，其中多态性条带172条，多态性比率83.1%，聚类结果与已知蓝莓杂交系谱相吻合。

RAPD标记是利用随机引物对基因组DNA进行扩增，通过检测扩增片段的多态性来反映DNA序列的差异。RAPD标记具有操作简便、快速、无需预先了解基因组序列信息等优点，但也存在重复性较差、显性遗传等缺点。李晓红等采用RAPD分子标记分析越橘的7个栽培品系，发现RAPD扩增条带有较强的多态性，多态性在33.3%～100%之间，聚类结果表明越橘各种群间遗传距离相对较远。

AFLP标记结合了RFLP和PCR技术的优点，通过对基因组DNA进行酶切、连接接头、预扩增和选择性扩增等步骤，产生丰富的多态性片段。AFLP标记具有多态性高、稳定性好、重复性强等优点，但操作相对复杂，成本较高。在植物研究中，AFLP标记常用于遗传多样性分析、遗传图谱构建等方面。

ISSR标记是在SSR标记的基础上发展起来的，它以锚定的微卫星DNA为引物，对两个相距较近、方向相反的微卫星DNA之间的一段DNA序