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生物信息学基因组分析演示文稿;生物信息学基因组分析;基因组、转录组和蛋白质组;本章内容提要;1.基因组的结构与内容;(1)基因的结构;基因组大小基因数;基因数量-生物复杂性？;GenotypetoPhenotype;isoform1;Phosphorylation;(4)相互作用网络;细胞信号通路;(5)非编码区;Functionalelements:Promotor;TranscriptionFactorBindingSite;Gal4pandKruppel;其他功能元件;Non-codingRNA;tRNArRNA;snoRNAs;microRNA/miRNA;Transposon;2.基因组注释;(1)基因组测序：鸟枪法;基因组的拼装;重复序列带来干扰;(2)基因预测;;基因的其他特征;HMMmodelforGenePrediction(Genie);(3)可变剪切的预测;部分有向图算法;3.比较基因组学;GeneOntology：基因本体论;GeneOntology：基因本体论;第三十七页，共五十五页。;功能显著性分析：超几何分布;;转录因子;4.基因/蛋白质的功能预测;(1)一级序列的比较;(2)保守的功能结构域;例：Nek2;(3)三级结构的比较;Ubiquitinvs.SUMO;序列相似性：~20%;结构相似性;(4)蛋白质相互作用的预测;;Conservationofgeneorder/bidirectionalpairs;;Correlatedsequencesignatures;PID模型：最大似然性法;谢谢大家！