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微生物多样性测序技术的方法创新与发展趋势
目录
文档简述................................................4
1.1研究背景与意义.........................................4
1.1.1微生物在生态系统中的作用.............................7
1.1.2微生物多样性的重要性.................................8
1.1.3微生物多样性测序技术的进展..........................11
1.2研究目的与内容........................................12
1.2.1研究目标............................................13
1.2.2研究内容概述........................................15
1.3文献综述..............................................16
1.3.1传统微生物多样性测序技术............................20
1.3.2新兴测序技术比较....................................21
1.3.3现有研究的不足与挑战................................24
微生物多样性测序技术的原理与方法.......................25
2.1微生物多样性的定义与分类..............................27
2.1.1微生物多样性的组成..................................29
2.1.2微生物多样性的层次结构..............................31
2.2微生物DNA提取技术.....................................32
2.2.1细菌DNA提取方法.....................................38
2.2.2真菌和古菌DNA提取方法...............................40
2.3DNA测序技术...........................................43
2.3.1高通量测序技术概述..................................46
2.3.2Illumina测序技术....................................50
2.4数据处理与分析........................................53
2.4.1序列比对与组装......................................56
2.4.2注释与功能预测......................................58
2.4.3多样性指数计算与评估................................59
微生物多样性测序技术的创新点...........................62
3.1高通量测序技术的进步..................................63
3.1.1测序速度的提升......................................64
3.1.2读长的增加..........................................66
3.1.3数据量的扩大........................................68
3.2新型测序平台的开发....................................71
3.2.1单分子测序技术......................................73
3.2.2纳米孔测序技术......................................76
3.2.3实时PCR测序技术.....................................77
3.3数据处理算法的优化....................................79
3.3.1错误校正算法的发展..................................81
3.3.2序列相似性分析算法的改进..............
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