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第1页,共38页,星期日,2025年,2月5日Genelibrary(Genomiclibrary):Acollectionofindependentclonesrepresentingtheentiregenomeofanorganism.FirststeptoisolateatargetDNAsequencefromanorganism’sgenome.第2页,共38页,星期日,2025年,2月5日1976L.Clark,J.Carbonn=ln(1-p)/ln(1-f)n:numbersofrecombinantrequiredinfulllibraryp:probabilityoftargetgeneinlibraryf:rateofaverageinsertionDNAsizestogenome第3页,共38页,星期日,2025年,2月5日Mammal3×109bpIfp=99%clonedfragment20kbf=20kb/3×109n=690773.2E.coli4639221bpp=99%f=20kb/4600kbn=1056.9p=99%f=10kb/4600kbn=2116第4页,共38页,星期日,2025年,2月5日cDNAlibrary:AcollectionofindependentclonesrepresentingtheentirecDNAreverselytranscriptedfrommRNAinaspecifictissueofanorganisminaspecificphage.第5页,共38页,星期日,2025年,2月5日BacterialcoloniesconsistingofgenomicDNAlibrary第6页,共38页,星期日,2025年,2月5日ChoosingvectorStepsoflibraryconstructionPlasmid10kb?Phage0-23kbCosmid~45kbBAC~100kb(250-300kb?)YAC~300kb-1.2Mb第7页,共38页,星期日,2025年,2月5日SUP4基因:酵母细胞Trp-tRNA基因的赭色突变抑制基因,含有克隆位点。在发生Ade2-赭色突变的宿主细胞中,如果没有外源基因的插入,则突变基因表达受抑制受体菌为Ade+,形成白色菌落;当有外源基因插入时,SUP4表达将被阻断,抑制作用被消除,受体菌为Ade-,菌落为红色。第8页,共38页,星期日,2025年,2月5日第9页,共38页,星期日,2025年,2月5日CosmidHalfof?phage.If?700000,cosmid350000(菌落数)CosmidisusuallyappliedinlargesizeDNAcloning,butitismuchmoredifficultthan?phage,becausethereisnomuchexperience.(pJB8andc2RBaremoreusedingenelibraryconstruction)第10页,共38页,星期日,2025年,2月5日?phagevector1970’s,likeCharon4Aand?gt-WES,15~20kbPresently,EMBLlines,like?2001,?DASH,Charon38-40,?GEM-11etc.(replacementvectors),20-24kb第11页,共38页,星期日,2025年,2月5日Basicprinciplesinchoosing?vectorEasilyrecoverforeignDNAfrom?;Easilyprepare2arms;Availabilityofvectorsequence,REmapping;Ambermutation(琥珀突变
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