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基因数据解读师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪种变异类型属于单核苷酸变异(SNV)?
A.单个碱基的插入
B.单个碱基的替换(如A→T)
C.100kb片段的重复
D.染色体倒位
答案:B
解析:SNV(SingleNucleotideVariant)指单核苷酸水平的变异,核心特征是单个碱基的替换(如A→T)。选项A为插入缺失(Indel),选项C为拷贝数变异(CNV),选项D为结构变异(SV),均不符合SNV定义。
基因数据解读中,GATK(GenomeAnalysisToolkit)的主要功能是?
A.原始测序数据质控(FastQC)
B.序列与参考基因组比对(BWA)
C.变异检测与校正(VariantCalling)
D.变异注释(ANNOVAR)
答案:C
解析:GATK是生物信息学中经典的变异检测工具,主要用于从比对后的BAM文件中识别SNV和Indel并进行校正。选项A对应FastQC,选项B对应BWA,选项D对应ANNOVAR,均非GATK核心功能。
临床意义未明的变异(VUS)在ACMG分类中对应的是?
A.Pathogenic(P)
B.LikelyPathogenic(LP)
C.VariantofUncertainSignificance(VUS)
D.LikelyBenign(LB)
答案:C
解析:ACMG(美国医学遗传学与基因组学学会)将变异分为5类:致病性(P)、可能致病性(LP)、意义未明(VUS)、可能良性(LB)、良性(B)。选项C直接对应VUS的标准表述。
以下哪个数据库主要存储人类基因变异的临床意义注释?
A.dbSNP
B.ClinVar
C.Ensembl
D.gnomAD
答案:B
解析:ClinVar是NCBI维护的临床相关变异数据库,专注于记录变异的致病性分类及支持证据。选项A(dbSNP)主要存储全人群变异频率,选项C(Ensembl)是综合基因组数据库,选项D(gnomAD)侧重非疾病人群变异频率,均非临床意义主库。
全外显子测序(WES)的主要局限性是?
A.无法检测拷贝数变异(CNV)
B.仅覆盖基因组的外显子区域(约1-2%)
C.测序深度不足(50×)
D.无法识别插入缺失(Indel)
答案:B
解析:WES通过捕获外显子区域进行测序,因此仅覆盖约1-2%的基因组,无法检测内含子、启动子等非外显子区域的变异。选项A错误(WES可间接检测部分CNV),选项C(测序深度可通过技术调整)、D(WES可识别Indel)均非主要局限。
基因检测报告中,“变异频率(AlleleFrequency)”通常指?
A.变异在样本中的测序覆盖深度
B.变异在人群中的发生比例(如gnomAD中的AF值)
C.变异在肿瘤组织中的克隆比例
D.变异与疾病表型的共分离率
答案:B
解析:变异频率(AF)一般指人群中携带该变异等位基因的比例,常用gnomAD、ExAC等数据库中的统计值表示。选项A为测序深度(Depth),选项C为肿瘤变异等位基因频率(VAF),选项D为共分离分析指标,均非AF定义。
以下哪种变异可能被判定为“良性”(Benign)?
A.在健康人群中的频率5%(如gnomADAF=0.1)
B.功能预测工具(如SIFT)提示“有害”
C.家系共分离分析显示变异与疾病表型完全共分离
D.文献报道该变异与疾病明确相关
答案:A
解析:ACMG指南中,人群频率过高(如AF1%)是支持良性的强证据(BS1)。选项B(功能预测有害)支持致病性(PS3),选项C(共分离)支持致病性(PS4),选项D(文献关联)支持致病性(PM5),均不符合良性标准。
肿瘤基因检测中,“胚系变异(GermlineVariant)”的来源是?
A.体细胞分裂过程中产生的突变
B.父母遗传的生殖细胞变异
C.环境因素诱导的后天突变
D.肿瘤克隆进化产生的新突变
答案:B
解析:胚系变异来自生殖细胞(精子/卵子),可遗传给后代;体细胞变异(如肿瘤中的变异)是后天获得的,不遗传。选项A、C、D均描述体细胞变异特征。
基因数据解读的伦理规范中,“知情同意”的核心要求是?
A.受检者只需签署纸质同意书
B.向受检者充分解释检测目的、风险及结果的局限性
C.检测机构可自行决定是否告知incidentalfindings(偶发结果)
D.未成年人可直接签署同意书
答案:B
解析:知情同意的核心是受检者在充分理解检测内容(包括潜在风险、结果局限性)后自愿参与。选项A(仅签署文件不够)、C(需按规范告知部分偶发结果)、D(未成年人需监护人签署)均不符合伦理要求。
以下哪种工具常用于基因组数据
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