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生物信息分析师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪个数据库是NCBI维护的基因表达公共数据库?
A.GenBank
B.GEO
C.Ensembl
D.UniProt
答案:B
解析:GEO(GeneExpressionOmnibus)是NCBI维护的基因表达数据存储库;GenBank是核酸序列数据库(A错误);Ensembl由欧洲生物信息研究所维护(C错误);UniProt是蛋白质数据库(D错误)。
Illumina测序技术的核心原理是?
A.纳米孔电流检测
B.边合成边测序
C.焦磷酸测序
D.半导体测序
答案:B
解析:Illumina采用可逆终止子介导的边合成边测序技术(B正确);纳米孔属于三代测序(A错误);焦磷酸测序是454技术(C错误);半导体测序是IonTorrent技术(D错误)。
以下哪个工具常用于短读长序列与参考基因组的比对?
A.BLAST
B.BWA
C.Salmon
D.MACS2
答案:B
解析:BWA(Burrows-WheelerAligner)专门用于短读长比对(B正确);BLAST是序列相似性搜索(A错误);Salmon是RNA-seq定量工具(C错误);MACS2是ChIP-seq峰识别工具(D错误)。
转录组学研究的主要对象是?
A.DNA序列变异
B.mRNA表达水平
C.蛋白质相互作用
D.表观遗传修饰
答案:B
解析:转录组学研究特定细胞或组织中所有mRNA的表达(B正确);DNA变异属于基因组学(A错误);蛋白质互作是蛋白组学(C错误);表观修饰是表观组学(D错误)。
测序数据质量控制中,Q30指标表示?
A.错误率为1%
B.错误率为0.1%
C.正确碱基比例为30%
D.平均测序深度30×
答案:B
解析:Q值计算公式为Q=-10×log??(P),Q30对应错误率P=10?3=0.1%(B正确);Q20对应1%错误率(A错误);Q30表示正确碱基比例≥99.9%(C错误);测序深度是覆盖次数(D错误)。
以下哪种文件格式用于存储比对后的测序数据?
A.FASTQ
B.FASTA
C.BAM
D.VCF
答案:C
解析:BAM(BinaryAlignment/Map)是SAM的二进制压缩格式,用于存储比对结果(C正确);FASTQ是原始测序数据(A错误);FASTA是序列文件(B错误);VCF是变异信息(D错误)。
GWAS(全基因组关联分析)主要用于研究?
A.单基因遗传病
B.复杂性状的遗传关联
C.肿瘤体细胞突变
D.基因表达调控网络
答案:B
解析:GWAS通过全基因组SNP标记关联分析复杂性状(如糖尿病、身高)的遗传因素(B正确);单基因病用家系连锁分析(A错误);肿瘤突变用外显子测序(C错误);调控网络用ChIP-seq或RNA-seq(D错误)。
以下哪个工具用于RNA-seq的差异表达分析?
A.GATK
B.DESeq2
C.PLINK
D.SPAdes
答案:B
解析:DESeq2是经典的RNA-seq差异表达分析工具(B正确);GATK用于变异检测(A错误);PLINK用于GWAS数据处理(C错误);SPAdes是基因组组装工具(D错误)。
三代测序(如PacBio)的主要优势是?
A.测序成本低
B.读长超长
C.错误率低
D.通量极高
答案:B
解析:三代测序(如PacBio)的核心优势是单分子长读长(可达数万bp)(B正确);成本高、错误率高(约15%)是其缺点(A、C错误);通量低于二代(D错误)。
以下哪个数据库用于蛋白质结构预测?
A.dbSNP
B.PDB
C.KEGG
D.ClinVar
答案:B
解析:PDB(ProteinDataBank)是蛋白质三维结构数据库(B正确);dbSNP存储SNP信息(A错误);KEGG是通路数据库(C错误);ClinVar是临床变异数据库(D错误)。
二、多项选择题(共10题,每题2分,共20分)(每题至少2个正确选项)
以下属于NGS(二代测序)数据预处理步骤的是?
A.使用FastQC进行质量评估
B.用Trimmomatic去除接头和低质量序列
C.用BWA进行与参考基因组比对
D.用Salmon进行转录本定量
答案:AB
解析:预处理包括质量控制(FastQC)和修剪(Trimmomatic)(AB正确);比对(BWA)和定量(Salmon)属于后续分析步骤(CD错误)。
GWAS分析常用的软件工具有?
A.PLINK
B.EMMAX
C.GATK
D.DESeq2
答案:AB
解析:PLINK用于GWAS数据管理和关联分析,EMMAX用于混合模型关联分
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