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2025年大学《生物信息学》专业题库——免疫组学数据解读与生物信息学技术研究
考试时间:______分钟总分:______分姓名:______
一、选择题(每题2分,共20分)
1.在RNA测序数据分析中,用于消除不同样本间测序深度差异的常用方法之一是?
A.TPM标准化
B.FPKM标准化
C.TMM标准化
D.RPKM标准化
2.对于单细胞RNA测序数据,以下哪项通常不是进行细胞质控时需要关注的关键指标?
A.核酸插入片段长度(LibrarySize)
B.每个细胞的基因检测数
C.每个细胞的UMI数
D.染色体片段数量
3.在进行ATAC测序数据分析时,识别潜在染色质开放区域的关键步骤是?
A.质量控制与过滤
B.计算核小体滑动分布
C.基因表达定量
D.差异峰识别
4.以下哪种算法通常不用于对高维免疫组学数据进行降维,以便于可视化或后续分析?
A.主成分分析(PCA)
B.t-分布随机邻域嵌入(t-SNE)
C.线性判别分析(LDA)
D.K-means聚类
5.ChIP测序中,用于检测目标蛋白结合位点富集区域的工具通常是?
A.DESeq2
B.Seurat
C.MACS2
D.Cufflinks
6.流式细胞术数据分析中,用于评估细胞群体同质性的常用统计指标是?
A.基因表达量
B.熵指数
C.FPKM值
D.可变位置数
7.在免疫组学研究中,GO富集分析主要用于?
A.比较不同样本的基因表达差异
B.识别与特定细胞亚群相关的生物学功能
C.探索基因之间的相互作用网络
D.对基因组进行注释
8.以下哪个数据库通常不包含大规模的基因表达、转录组或蛋白质组学数据集?
A.GEO(GeneExpressionOmnibus)
B.STRING(SearchToolfortheRetrievalofInteractions/Networks)
C.UniProt
D.TCGA(TheCancerGenomeAtlas)
9.当需要比较不同条件下免疫细胞亚群的分布差异时,除了t-SNE图外,还常使用的可视化方法是?
A.热图
B.散点图矩阵
C.维恩图
D.二维密度图
10.开源生物信息学软件R语言在免疫组学数据分析中的优势之一是拥有丰富的专用包,以下哪个包是进行单细胞数据标准化和降维分析的常用工具?
A.Bioconductor
B.limma
C.Seurat
D.scikit-learn
二、填空题(每空1分,共15分)
1.RNA测序技术通过测量细胞的转录本丰度,主要反映了细胞的________状态。
2.ATAC测序利用的是________的原理,通过检测酶切的DNA片段来识别染色质开放区域。
3.ChIP测序技术中,用于富集目标蛋白结合DNA片段的步骤通常称为________。
4.流式细胞术通过检测细胞表面的________或细胞内的________来对细胞进行分选。
5.在单细胞数据分析中,常用的降维方法包括________和________。
6.GO富集分析可以帮助我们识别在特定条件下显著________的生物学过程、分子功能和细胞组分。
7.评估RNA测序数据质量时,需要关注的主要指标包括________、_______和________。
8.生成ChIP测序数据时,常用的测序平台有________和________。
三、简答题(每题5分,共20分)
1.简述RNA测序数据分析中,差异表达基因识别的基本流程。
2.解释什么是批次效应,并列举至少两种常用的去除批次效应的方法。
3.描述在进行单细胞RNA测序数据分析时,进行细胞质控的主要步骤和关注点。
4.简述免疫组学研究中,利用生物信息学方法构建细胞类型或亚群特异性分子标记集的一般思路。
四、论述题(每题10分,共20分)
1.论述生物信息学技术在揭示免疫细胞异质性和功能调控中的关键作用。
2.结合具体的免疫学问题,阐述如何设计一个包含数据预处理、分析和解读的完整生物信息学研究流程。
试卷答案
一、选择题
1.C
2.A
3.D
4.D
5.C
6.B
7.
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