辣椒NRT基因家族的系统鉴定、进化与表达分析.pdfVIP

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南京农业大学学报２０２４ꎬ４７(４):６５３６６４ｈｔｔｐ://ｎａｕｘｂ.ｎｊａｕ.ｅｄｕ.ｃｎ

ＪｏｕｒｎａｌｏｆＮａｎｊｉｎｇＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙＤＯＩ:１０.７６８５/ｊｎａｕ.２０２３０７００６

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牛佳斌ꎬ唐凯ꎬ夏迎萌ꎬ等.辣椒ＮＲＴ基因家族的系统鉴定、进化与表达分析[Ｊ].南京农业大学学报ꎬ２０２４ꎬ４７(４):６５３６６４.

ＮＩＵＪｉａｂｉｎꎬＴＡＮＧＫａｉꎬＸＩＡＹｉｎｇｍｅｎｇꎬｅｔａｌ.ＩｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎꎬｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｎｄｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎａｎａｌｙｓｉｓｏｆｔｈｅＮＲＴｇｅｎｅｆａｍｉｌｙｉｎＣａｐｓｉｃｕｍａｎｎｕｕｍ[Ｊ].Ｊｏｕｒｎａｌ

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辣椒ＮＲＴ基因家族的系统鉴定、进化与表达分析

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牛佳斌ꎬ唐凯ꎬ夏迎萌ꎬ刘同坤ꎬ孙小川ꎬ段伟科ꎬ黄志楠

(１.淮阴工学院生命科学与食品工程学院ꎬ江苏淮安２２３００３ꎻ２.南京农业大学作物遗传与种质创新利用全国重点实验室/

农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室/园艺学院ꎬ江苏南京２１００９５)

摘要:[目的]本研究旨在鉴定辣椒硝酸盐转运蛋白(ＮＲＴ)基因家族成员ꎬ分析其基本性质、染色体定位、进化关系以及在不

同组织、不同果实发育阶段和不同非生物胁迫下的表达特征ꎮ[方法]利用生物信息学方法在辣椒‘遵辣１号’基因组中鉴

定ＮＲＴ基因家族并分析其理化性质、基因结构、染色体定位、共线性、顺式作用元件分布和进化关系等ꎻ利用转录组数据分

析辣椒ＮＲＴ(ＣａＮＲＴ)基因在不同组织和不同果实发育阶段中的表达特征ꎬ并利用ＲＴ￣ｑＰＣＲ技术分析在不同非生物胁迫下

的表达模式ꎮ[结果]辣椒中共包含７３个ＣａＮＲＴ基因ꎬ不均匀分布在１０条染色体上ꎮ系统进化分析表明ꎬＣａＮＲＴ基因可

分为３个亚家族ꎬ同一亚家族具有相似基因结构和保守基序ꎮ顺式作用元件分析结果表明ＣａＮＲＴ可能受光、激素、逆境胁

迫等多种因素调控ꎮＣａＮＲＴ１亚家族成员主要在根、茎、叶中表达量较高ꎬＣａＮＲＴ２亚家族在任何时期表达量都较低ꎬ

ＣａＮＲＴ３亚家族存在组织表达差异性ꎬ主要在根中高表达ꎮ逆境胁迫数据表明ꎬＣａＮＲＴ１.１８、ＣａＮＲＴ３.３、ＣａＮＲＴ３.１、ＣａＮＲＴ２.１、

ＣａＮＲＴ１.２３在低温、高温、干旱、盐和氧化处理下明显响应ꎬ所有ＣａＮＲＴ基因在低温处理时均有不同程度的正向响应ꎮ[结

论]在辣椒基因组中共鉴定获得７３个ＣａＮＲＴ基因ꎬ筛选出多个在辣椒生长发育和逆境胁迫中具有重要作用的关键基因ꎮ

关键词:辣椒ꎻ硝酸盐转运蛋白(ＮＲＴ)ꎻ系统进化ꎻ表达分析ꎻ非生物胁迫

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中图分类号:Ｓ６４１.３文献标志码:Ａ文章编号:１０００２０３０(２０２４)０４０６５３１２

Ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎꎬｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｎｄｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ