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刺五加NAC转录因子基因的适应性进化分析四

董靖,赵雪蕾,王硕,龙月红,邢朝斌期

(华北理工大学生命科学学院,河北唐山063210)

摘要:对药用植物刺五加(Eleutherococcussenticosus)的NAC转录因子进行适应性进化分析,使用MEC模型和PAML业

软件中的3种模型:分支模型、位点模型、分支-位点模型的SLAC、FEL和REL算法对刺五加的116条NAC基因进行技

适应性进化分析。结果表明:从PAML模型与MEC模型的分析结果中未发现正选择位点,而在分支与位点模型中负选通

择起主导作用;算法SLAC、REL和FEL的分析结果同样显示,刺五加的NAC转录因子中存在大量负选择位点。通过

亚细胞定位和二级结构分析发现,NAC转录因子发挥作用的位置大部分在细胞核中并且大量负选择位点位于无规则卷

曲中。结论:纯化选择在NAC转录因子进化过程中发挥主要作用,而NAC转录因子发挥作用的部位可能在无规则卷

曲的二级结构中。本文为进一步探究刺五加NAC转录因子的系统进化关系奠定了基础。

关键词:刺五加;Eleutherococcussenticosus;NAC转录因子;适应性进化

中图分类号:S567.19;Q343.1文献标识号:A文章编号:2097—0285(2024)05—0033—06

D0l:10.13456/ki.lykt.2023.09.01.0003

刺五加(Eleutherococcussenticosus)俗称“西伯利是指一种在某个群体中固定下来的既可以提高个体

亚人参”,野生分布在中国东北部、朝鲜半岛和俄罗斯适应度也有利于突变的等位基因选择作用,以适应不

南部[1],是我国的传统药用植物,具有多种药理作用。同的生存环境[9]。表现在蛋白质氨基酸序列上的正

如改善外周血循环、抗疲劳、调节免疫、预防和延缓神选择,非同义突变率(dN)高于同义突变率(dS),即

1,若显著大于1则将其视为蛋白质发生适应性

经元细胞凋亡[2]、增强和恢复记忆[3]。刺五加经历了

长期的进化过程,不同极端环境的选择作用使其产生进化的证据[10]。NAC转录因子活性在单双子叶植物

了高度适应环境的次生代谢产物,比如苯丙烷苷、香和中高低等植物中具有较大差异,环境压力可能导致

豆素、酚酸、类黄酮和多糖等多种化学成分[,其中发其编码基因产生了适应性进化。目前,尚未发现采用

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