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2025年大学《生物信息学》专业题库——生物信息学在疫苗设计研发中的应用
考试时间:______分钟总分:______分姓名:______
一、选择题(每题2分,共20分)
1.在流感病毒疫苗的设计中,利用生物信息学工具比对不同年份病毒株的抗原基因序列,主要目的是什么?
A.发现病毒基因的启动子区域
B.预测病毒的致病性
C.找出抗原表位的变异位点,以设计广谱疫苗
D.确定病毒基因的功能注释
2.以下哪项技术通常不直接用于mRNA疫苗的序列设计优化?
A.核糖核苷酸序列比对
B.k-mer频率分析
C.真核翻译起始信号(Kozak序列)预测
D.蛋白质三级结构预测
3.预测一个线性表位能否被MHCI类分子呈递,以下哪个因素通常不被考虑?
A.表位的氨基酸序列长度
B.MHCI类分子的分型
C.表位与MHC结合基序(BIM)的匹配度
D.表位在蛋白质三维结构中的位置
4.下列哪个数据库最常被用于检索和下载已知的免疫表位信息?
A.GenBank
B.UniProt
C.ImmuneEpitopeDatabase(IEDB)
D.PDB
5.在设计基于病毒样颗粒(VLP)的疫苗时,利用生物信息学预测其结构稳定性主要基于什么数据?
A.病毒基因组序列
B.蛋白质一级结构同源性分析
C.人类血清抗体数据库
D.临床前动物试验结果
6.生物信息学在疫苗临床试验阶段的主要应用不包括:
A.分析队列数据以识别潜在的遗传易感性
B.预测疫苗在不同人群中的免疫效果
C.设计疫苗生产过程中的质控序列
D.整合多组学数据以发现免疫相关生物标志物
7.当需要设计能够诱导强大细胞免疫应答的广谱流感疫苗抗原时,生物信息学工具可能会优先关注预测哪些区域的表位?
A.高度保守的内部蛋白区域
B.易于被黏膜免疫系统识别的表面区域
C.变异率高但包含关键免疫原性表位的区域
D.被大量抗体遮蔽的隐藏区域
8.基于已知毒株的基因组数据,使用生物信息学方法预测病毒未来的进化趋势,这属于哪个范畴?
A.序列比对与进化分析
B.抗原设计
C.临床试验数据分析
D.疫苗效力预测
9.使用HMMER软件在蛋白质序列数据库中搜索特定结构域家族时,主要利用了该结构域的什么信息?
A.三维结构坐标
B.二级结构预测
C.模式(Profile)或隐马尔可夫模型(HMM)
D.表位预测结果
10.对于mRNA疫苗,生物信息学在序列设计时需要特别考虑避免哪些序列元件?
A.高度保守的基因编码区
B.可能被宿主核酸酶切割的序列
C.与宿主mRNA启动子完全相同的序列
D.富含稀有密码子的序列
二、填空题(每空2分,共20分)
1.利用生物信息学分析病原体基因组,可以追踪其传播路径,常用的分析手段包括系统发育树构建和________分析。
2.预测MHCII类分子呈递的免疫表位通常需要考虑表位与________的结合以及表位在抗原肽结合槽内的________。
3.mRNA疫苗设计中,为了提高翻译效率和稳定性,常需优化核糖体结合位点(RBS)或Kozak序列,这属于________优化。
4.在评估候选疫苗抗原的免疫原性时,生物信息学工具可以预测其________特性,如T细胞表位的MHC结合亲和力或B细胞表位的构象依赖性。
5.VLP疫苗的设计中,常利用生物信息学预测病毒衣壳蛋白的________和相互作用,以确保其能够正确自组装。
6.生物信息学分析疫苗临床试验数据时,可以整合来自血液、尿液等多组样本的________数据,以发现潜在的免疫生物标志物。
7.当利用生物信息学方法设计一个多表位疫苗时,需要平衡各表位之间的________,避免免疫抑制或交叉反应。
8.基因组测序技术的进步使得生物信息学在快速识别病原体变异(如耐药性或抗原变异)方面发挥着越来越重要的作用,例如通过________检测SNP。
9.为了提高疫苗的广谱保护力,生物信息学可以帮助设计能够覆盖多种变异株的________抗原。
10.生物信息学在疫苗研发中的应用贯穿了从病原体鉴定、抗原设计、疫苗构建到________和效果评估的整个流程。
三、简答题(每题5分,共15分
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