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再生医学ChIP-seq分析师岗位考试试卷及答案

一、单项选择题（每题2分，共10题）

1.ChIP-seq技术主要用于研究（）

A.DNA甲基化B.基因表达C.蛋白质与DNA的相互作用D.RNA剪接

2.以下哪种酶常用于ChIP实验中交联的逆转（）

A.蛋白酶KB.限制性内切酶C.Taq酶D.连接酶

3.ChIP-seq文库构建过程中需要用到的工具是（）

A.离心机B.移液器C.超声破碎仪D.测序仪

4.与ChIP-seq数据分析相关的软件是（）

A.PhotoshopB.R语言C.OfficeD.AutoCAD

5.实验样本ChIP后的DNA片段长度一般在（）

A.100-200bpB.200-500bpC.500-800bpD.800-1000bp

6.ChIP-seq数据比对常用的参考基因组数据库是（）

A.NCBIB.UniProtC.EnsemblD.PDB

7.ChIP-seq实验中，抗体的作用是（）

A.扩增DNAB.沉淀目标蛋白-DNA复合物C.标记DNAD.降解RNA

8.下列关于ChIP-seq技术优势的说法，错误的是（）

A.高分辨率B.可全基因组范围分析C.无需抗体D.能发现新的调控区域

9.构建ChIP-seq文库时，DNA末端修复的目的是（）

A.提高DNA稳定性B.便于连接接头C.去除杂质D.扩增DNA片段

10.进行ChIP-seq数据分析时，需要对数据进行的预处理步骤是（）

A.标准化B.基因注释C.差异表达分析D.构建系统发育树

答案：1.C2.A3.C4.B5.B6.C7.B8.C9.B10.A

二、多项选择题（每题2分，共10题）

1.ChIP-seq实验中可能用到的试剂有（）

A.甲醛B.甘氨酸C.乙醇D.蛋白酶K

2.以下属于ChIP-seq数据分析步骤的有（）

A.数据比对B.峰识别C.基因注释D.差异表达分析

3.选择ChIP实验抗体时需要考虑的因素有（）

A.特异性B.亲和力C.抗体来源D.价格

4.影响ChIP-seq实验结果的因素包括（）

A.样本质量B.抗体质量C.实验操作D.数据分析方法

5.ChIP-seq文库构建的主要流程包括（）

A.DNA片段化B.末端修复C.接头连接D.文库扩增

6.与ChIP-seq技术类似的技术有（）

A.DNase-seqB.ATAC-seqC.RNA-seqD.MeDIP-seq

7.利用ChIP-seq技术可以研究的生物学过程有（）

A.基因转录调控B.染色质重塑C.细胞分化D.肿瘤发生

8.数据分析过程中，用于可视化ChIP-seq数据的工具可能有（）

A.IGVB.UCSCGenomeBrowserC.GraphPadPrismD.Excel

9.ChIP-seq技术在再生医学中的应用方向包括（）

A.干细胞分化机制研究B.组织修复调控研究C.疾病发病机制研究D.药物研发靶点发现

10.ChIP-seq实验样本可以来源于（）

A.细胞系B.组织C.血液D.尿液

答案：1.ABCD2.ABC3.ABC4.ABCD5.ABCD6.ABD7.ABCD8.AB9.ABCD10.ABC

三、判断题（每题2分，共10题）

1.ChIP-seq技术可以直接测定DNA的序列。（）

2.超声破碎的时间和强度对ChIP实验结果没有影响。（）

3.在ChIP-seq数据分析中，峰识别是为了确定蛋白质与DNA结合的区域。（）

4.构建ChIP-seq文库时，DNA片段化的方法只有超声破碎一种。（）

5.ChIP-seq实验不需要设置对照。（）

6.不同物种的ChIP-seq实验流程和数据分析方法完全相同。（）

7.抗体的浓度对ChIP实验的结果有影响。（）

8.进行ChIP-seq数据分析时，不需要对测序深度进行标准化。（）

9.ChIP-seq技术可用于研究非编码DNA区域的调控功能。（）

10.ChIP-seq文库的质量不会影响测序结果。（）

答案：1.×2.×3.√4.×5.×6.×7.√8.×9.√10.×

四、简答题（每题5分，共4题）

1.简述ChIP-seq技术的基本原理。

答案：先通过甲醛交联使细胞内蛋白质与DNA结合，然后超声破碎将染色质打断成小片段。用特异性抗体免疫沉淀目标蛋白-DNA复合物，逆转交联后回收DNA片段，构建文库进行高通量测序，通过数据分析确定蛋白质在基因组上的结合位点。

2.列举ChIP-seq实验中超声破碎的作用。

答案：超声破碎可将染色质随机打断成合适长度的片段，一般200-500bp，这样有利于后续抗体对目标蛋白-DNA复合物的免疫沉淀，使沉淀的复合物更均一，提高实验的准确性和可重复性，也便于文库构建和测序分析。

3.说明ChIP-seq数据分析中峰识别的意义。

答案：峰识别能找出基因组上蛋白质与DNA结合