茶树CsTLRs基因密码子偏好性与进化分析.pdfVIP

江苏农业学报(ＪｉａｎｇｓｕＪ.ｏｆＡｇｒ.Ｓｃｉ.)ꎬ２０２５ꎬ４１(５):９９６￣１００８

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陈佳莉ꎬ代洪苇ꎬ周丽娟ꎬ等.茶树ＣｓＴＬＲｓ基因密码子偏好性与进化分析[Ｊ].江苏农业学报ꎬ２０２５ꎬ４１(５):９９６￣１００８.

ｄｏｉ:１０.３９６９/ｊ.ｉｓｓｎ.１０００￣４４４０.２０２５.０５.０１８

茶树ＣｓＴＬＲｓ基因密码子偏好性与进化分析

１ꎬ２１ꎬ２３１ꎬ２１ꎬ２

陈佳莉ꎬ代洪苇ꎬ周丽娟ꎬ童华荣ꎬ袁连玉

(１.西南大学食品科学学院ꎬ重庆４００７１５ꎻ２.川渝共建特色食品重庆市重点实验室ꎬ重庆４００７１５ꎻ３.重庆北碚农业发展有限

公司ꎬ重庆４００７１５)

摘要:ＴＬＲ基因具有调控植物毛状体生长发育的作用ꎬ而叶片毛状体(茸毛)是茶树[Ｃａｍｅｌｌｉａｓｉｎｅｎｓｉｓ(Ｌ.)]

的重要形态特征之一ꎬ在茶树的生理、生态和茶叶品质方面均发挥着重要作用ꎮ本研究利用ＣｏｄｏｎＷ、ＥＭＢＯＳＳ等

软件ꎬ通过中性绘图、奇偶偏好性分析(ＰＲ２￣ｐｌｏｔ)等多种分析方法ꎬ对茶树ＣｓＴＬＲｓ基因的密码子参数、亲缘关系以

及异源表达受体等方面进行分析ꎮ结果表明ꎬ茶树ＣｓＴＬＲｓ基因密码子使用偏好性较弱ꎬ偏好性形成主要来源于自

然选择ꎻ筛选出２０个最优密码子ꎬ多以Ａ/Ｕ结尾ꎻ编码序列(ＣＤＳ)和相对同义密码子使用度(ＲＳＣＵ)聚类分析结

果都显示ꎬ茶树ＣｓＴＬＲｓ基因与杨树、黄瓜亲缘关系更近ꎻ烟草、拟南芥和番茄可作为ＣｓＴＬＲｓ异源转化的植物受体ꎬ

酿酒酵母可作为微生物异源表达受体ꎮ综上ꎬ本研究结果明确了ＣｓＴＬＲｓ基因在调控茶树叶片毛状体发育时的密

码子使用特征ꎬ为后续ＣｓＴＬＲｓ基因的功能研究提供了重要参考ꎮ

关键词:茶树ꎻ叶片毛状体ꎻＣｓＴＬＲｓ基因ꎻ密码子偏好性ꎻ进化分析

中图分类号:Ｓ５７１.１文献标识码:Ａ文章编号:１０００￣４４４０(２０２５)０５￣０９９６￣１３

ＣｏｄｏｎｂｉａｓａｎｄｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙａｎａｌｙｓｉｓｏｆＣｓＴＬＲｓｉｎｔｅａｐｌａｎｔ

１ꎬ２１ꎬ２３１ꎬ２１ꎬ２

ＣＨＥＮＪｉａｌｉꎬＤＡＩＨｏｎｇｗｅｉꎬＺＨＯＵＬｉｊｕａｎꎬＴＯＮＧＨｕａｒｏｎｇꎬＹＵＡＮＬｉａｎｙｕ

(１.ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＦｏｏｄＳｃｉｅｎｃｅꎬＳｏｕｔｈｗｅｓｔＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＣｈｏｎｇｑｉｎｇ４００７１５ꎬＣｈｉｎａꎻ２.ＣｈｏｎｇｑｉｎｇＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＳｐｅｃｉａｌｉｔｙＦｏｏｄＣｏ￣ＢｕｉｌｔｂｙＳｉｃｈｕａｎａｎｄ

ＣｈｏｎｇｑｉｎｇꎬＣｈｏｎｇｑｉｎｇ４００７１５ꎬＣｈｉｎａꎻ３.ＣｈｏｎｇｑｉｎｇＢｅｉｂｅｉＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＤｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔＣｏ.ꎬＬｔｄ.ꎬＣｈｏｎｇｑｉｎｇ４００７１５ꎬＣｈｉｎａ)

Ａｂｓｔｒａｃｔ:ＴｈｅＴＬＲｇｅｎｅｈａｓｔｈｅｆｕｎｃｔｉｏｎｏｆｒｅｇｕｌａｔｉｎｇｔｈｅｇｒｏｗｔｈａｎｄｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｏｆｐｌａｎｔｔｒｉｃｈｏｍｅｓ.Ｌｅａｆｔｒｉｃｈｏｍｅｉｓ

ｏｎｅｏｆｔｈｅｉｍｐｏｒｔａｎｔｍｏｒｐｈｏｌｏｇｉｃａｌｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓｏｆＣａｍｅｌｌｉａｓｉｎｅｎｓｉｓ(Ｌ.)ꎬｗｈｉｃｈｐｌａｙｓａｎｉｍｐｏｒｔａｎｔｒｏｌｅｉｎｔｈｅｐｈｙｓｉｏｌｏｇｙ

ａｎｄｅｃｏｌｏｇｙｏｆｔｅａｐｌａｎｔａｎｄｔｅａｑｕａｌｉｔｙ.Ｉｎｔｈｉｓｓｔｕｄｙꎬｗｅｃｏｎｄｕｃｔｅｄａｃｏｍｐｒｅｈｅｎ