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基因工程基本操作技术;第一节离心技术;生物样品悬浮液在高速旋转下,由于巨大的离心力作用,使悬浮的微小颗粒(细胞器、生物大分子的沉淀等)以一定的速度沉降,从而与溶液得以分离。
沉降速度取决于颗粒的质量、大小和密度。
离心技术主要用于各种生物样品的分离和制备。
离心技术在生物科学,特别是在生物化学和分子生物学研究领域,己得到十分广泛的应用,每个生物化学和分子生物学实验室都要配置各种类型的离心机。;一、基本原理;∴RCF=1.119×10-5×(rpm)2r
rpm---revolutionsperminute为每分钟转数,r/min
低速离心时常以转速“rpm”来表示
高速离心时则以“g”表示;;二、离心机的主要构造和类型;1、制备性离心机可分为三类
离心机一般有离心主机,转头和离心管三部分组成。
(1)普通离心机:最大转速6000rpm左右
(2)高速冷冻离心机:最大转速为20000~25000rpm(r/min)
(3)超速离心机:转速可达50000~80000rpm,装有真空系统,这是它与高速离心机的主要区别。;;;2、转头;;(2)水平转子;;
(3)区带转头:
区带转头无离心管,主要由一个转子桶和可旋开的顶盖组成。
(4)垂直转头:
其离心管是垂直放置的。
(5)连续流动转头:
转头与区带转头类似,由转子桶和有入口和出口的转头盖及附属装置组成。
;DNA中含有蛋白、多糖
洗涤时,最好用枪头将洗涤液吸出,勿倾倒
DNA中残留有金属离子
上样量超过3ug,电压超过6V/cm,电泳缓冲液陈旧,均可能导致28S和18S条带分不开。
③减少物理因素对核酸的降解。
液氮长期保存,-70℃短期保存
变性的时间不要过长(5分钟),否则质粒易被打断
针对不同材料,选择适当的裂解预处理方式:
液体不得装得过多,以防离心时甩出,造成转头不平衡、生锈或被腐蚀。
(3)区带转头:
(1)提取物质的结构与性质(与其溶解度有关)如:极性物质易溶于极性溶剂,非极性物质易溶于非极性溶剂,酸性物质易溶于碱性溶剂,碱性物质易溶于酸性溶剂,两性电解质在pI时,溶解度最少。
引物和模板的非特异性退火;;离心操作的注意事项;
装载溶液时,根据待离心液体的性质及体积选用适合的离心管。???体不得装得过多,以防离心时甩出,造成转头不平衡、生锈或被腐蚀。
若要在低于室温的温度下离心时。转头在使用前应放置在冰箱或置于离心机的转头室内预冷。
每个转头各有其最高允许转速和使用累计期限,使用转头时要查阅说明书,不得过速使用。
;;
根据离心原理,按照实际工作的需要,目前已有可设计出各种离心方法综合起来大致可分为:;用差速离心法分离已破碎的细胞各组份;常用的梯度材料:
1.糖类:蔗糖、甘油、聚蔗糖(Ficoll)、右旋糖酐、糖原
2.无机盐类:CsCl(氯化铯)、RbCl(氯化铷)、NaCl、KBr等
3.有机碘化物:三碘苯甲酰匍萄糖胺等
4.硅溶胶:如Percoll。
5.蛋白质:如牛血清白蛋白
6.重水
7.非水溶性有机物:如氟代碳等
;1.测定生物大分子的相对分子重量
沉降速度
沉降平衡
接近沉降平衡
2.生物大分子的纯度估计
3.分析生物大分子中的构象变化
;;第二节核酸的提取、纯化与含量测定;;核酸的分类;一、核酸提取的基本原理;二、核酸提取的原理;1.核酸制备的一般原则;(2)核酸纯化应达到的要求:;2.核酸制备时应注意的事项:;3.核酸制备的一般方法和原理;;;使用扩增级DNaseⅠ处理RNA
提取血液基因组DNA时,要选择有核细胞(白细胞)
另外某些富含内源酶的样品(如脾脏,胸腺等),很难避免RNA的降解。
2、影响提取的主要因素:
细胞器DNA,首先纯化细胞器。
然后,将这两点间划一条直线,在图中间RCF标尺上的交叉点极为相应的相对离心力数值。
降低温度,改变pH及盐的浓度,都利于对核酸酶活性的抑制,但均不如利用核酸酶抑制剂更有利,当然,几个条件并用更好。
沉淀或吸附核酸,并去除杂质
用PEG8000代替乙醇沉淀DNA:在500μLDNA液中加入200μl20%PEG8000(含1.
可以先将材料贮存在TRIzol或样品贮存液中,于-70℃或-20℃保存
①应保证核酸一级结构的完整性
合成cDNA第一链合成的引物退火失败
(1)提取物质的结构与性质(与其溶解度有关)如:极性物质易溶于极性溶剂,非极性物质易溶于非极性溶剂,酸性物质易溶于碱性溶剂,碱性物质易溶于酸性溶剂,两性电解质在pI时,溶解度最少。
01mol/LEDTA或柠檬酸钠,DNase基本可以全部失活。
③某些蛋白质变性剂也有抑制
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