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再生医学转录组学分析师岗位考试试卷及答案
一、单项选择题（每题2分，共20分）
1.转录组学研究的是（）
A.DNA序列B.RNA表达C.蛋白质结构D.细胞代谢
答案：B
2.以下哪种技术常用于转录组测序（）
A.PCRB.WesternblotC.RNA-seqD.ELISA
答案：C
3.基因表达水平的衡量指标通常是（）
A.启动子活性B.mRNA丰度C.内含子长度D.密码子偏好性
答案：B
4.转录起始位点通常位于（）
A.编码区B.3’UTRC.5’UTRD.内含子
答案：C
5.差异表达分析的主要目的是（）
A.寻找新基因B.确定基因功能C.发现表达有变化的基因D.构建基因调控网络
答案：C
6.对转录组数据进行标准化的原因是（）
A.去除测序误差B.统一数据量纲C.增加数据准确性D.提高分析速度
答案：B
7.以下属于转录组数据分析软件的是（）
A.PhotoshopB.R语言C.AutoCADD.Word
答案：B
8.转录因子的作用是（）
A.催化转录B.调控基因转录C.合成蛋白质D.修饰RNA
答案：B
9.构建基因共表达网络的基础是（）
A.基因序列相似性B.基因表达相关性C.基因功能相似性D.基因位置关系
答案：B
10.衡量测序数据质量的常用指标是（）
A.GC含量B.读长C.Q值D.覆盖度
答案：C
二、多项选择题（每题2分，共20分）
1.转录组学研究的样本来源可以是（）
A.细胞B.组织C.血液D.尿液
答案：ABC
2.RNA种类包括（）
A.mRNAB.tRNAC.rRNAD.miRNA
答案：ABCD
3.转录组数据分析流程包括（）
A.数据预处理B.基因表达定量C.差异表达分析D.功能富集分析
答案：ABCD
4.功能富集分析常用的数据库有（）
A.GOB.KEGGC.ReactomeD.UniProt
答案：ABC
5.以下哪些因素可能影响基因表达（）
A.环境因素B.发育阶段C.疾病状态D.遗传背景
答案：ABCD
6.转录组测序文库构建的步骤包括（）
A.RNA提取B.cDNA合成C.片段化D.连接接头
答案：ABCD
7.差异表达基因筛选的常用方法有（）
A.FoldchangeB.p-valueC.FDRD.TPM
答案：ABC
8.转录组学在再生医学中的应用包括（）
A.细胞分化机制研究B.组织修复研究C.疾病诊断标志物发现D.药物靶点筛选
答案：ABCD
9.数据可视化工具包括（）
A.ggplot2B.GraphPadPrismC.CytoscapeD.Excel
答案：ABCD
10.基因调控网络中的节点可以是（）
A.基因B.转录因子C.miRNAD.蛋白质
答案：ABC
三、判断题（每题2分，共20分）
1.转录组是指细胞在某一状态下所有转录本的集合。（）
答案：对
2.RNA-seq只能测mRNA的序列。（）
答案：错
3.差异表达基因的Foldchange越大，其表达变化越显著。（）
答案：对
4.基因表达水平与蛋白质含量一定呈正相关。（）
答案：错
5.数据标准化可以消除样本间的技术差异。（）
答案：对
6.转录因子结合位点都在基因启动子区域。（）
答案：错
7.功能富集分析可以确定基因的具体功能。（）
答案：错
8.转录组测序读长越长，数据质量越好。（）
答案：错
9.基因共表达网络中边的权重代表基因表达相关性的强弱。（）
答案：对
10.转录组学研究不需要生物学重复。（）
答案：错
四、简答题（每题5分，共20分）
1.简述转录组学在再生医学研究中的意义。
答案：转录组学可揭示细胞分化、组织修复等过程中基因表达变化，帮助理解再生机制。能发现疾病诊断标志物和药物靶点，为再生医学治疗提供依据，推动细胞治疗、组织工程等发展。
2.简述差异表达分析的主要步骤。
答案：先对转录组测序数据进行预处理，包括去除低质量reads等；接着进行基因表达定量；然后选择合适方法计算差异倍数和p值；最后进行多重检验校正，筛选出差异表达基因。
3.简述功能富集分析的原理。
答案：将一组基因与已知功能数据库比对，统计基因在各功能类别中的富集程度。通过超几何分布等算法计算富集显著性，判断该组基因是否在某些功能上过度出现。
4.简述RNA-seq文库构建的关键步骤。
答案：首先提取高质量RNA，然后反转录合成cDNA，对cDNA进行片段化处理，接着连接测序接头，最后进行PCR扩增富集文库，确保文库质量和数量满足测序要求。
五、讨论题（每题5分，共20分）
1.讨论转录组学数据假阳性和假阴性结果产生的原因及解决方法。
答案：假阳性原因有实验误差、数据分析参数设置不当等；假阴性可能因测序深度不足、基因低表达难检测。解决方法包括增加生物学重复、优化实验流程、合理选择分析方法和参数、结合多种技术验证
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