2025年大学《生物信息学》专业题库—— 生物信息学在药物设计中的应用.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——生物信息学在药物设计中的应用

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、选择题（每题2分，共20分）

1.在药物设计中，用于预测分子与靶点结合亲和力的主要技术是？

A.核酸序列比对

B.蛋白质结构域识别

C.分子对接

D.系统发育树构建

2.下列哪个数据库是主要收集和提供小分子化合物信息及生物活性的资源？

A.PDB

B.UniProt

C.DrugBank

D.NCBIGenBank

3.分子动力学模拟的主要目的是什么？

A.预测化合物的吸收、分布、代谢、排泄和毒性（ADMET）

B.计算分子的三维结构

C.模拟分子在生理条件下的动态行为和相互作用

D.评估分子的量子化学性质

4.QSAR模型中，“分子描述符”通常指的是什么？

A.蛋白质靶点的三维结构信息

B.描述分子化学结构和性质的数学参数

C.虚拟筛选得到的候选化合物列表

D.分子对接的评分结果

5.药物靶点识别的早期阶段可能利用哪些生物信息学方法？

A.基因表达谱分析

B.蛋白质序列保守性分析

C.信号通路数据库检索

D.以上所有

6.在药物设计中，用于评估候选药物分子对非靶点相互作用风险的工具是？

A.分子对接

B.ADME预测模型

C.毒理学数据库查询

D.QSAR模型

7.蛋白质结构数据库PDB的主要用途是什么？

A.存储基因序列

B.存储DNA序列

C.提供蛋白质及核酸的三维结构坐标

D.预测蛋白质功能

8.虚拟筛选技术中，基于结构的筛选通常使用什么作为查询分子？

A.小分子化合物库

B.蛋白质靶点结构

C.蛋白质序列

D.化学反应路径

9.影响分子对接结果准确性的重要因素之一是？

A.使用的分子力场

B.查询分子的准备质量

C.靶点蛋白质的解析度

D.以上所有

10.利用生物信息学方法预测药物在特定组织中的分布特性，属于哪个方面的应用？

A.靶点识别

B.虚拟筛选

C.ADMET研究

D.药物作用机制研究

二、简答题（每题5分，共20分）

1.简述利用生物信息学方法进行虚拟筛选的基本流程。

2.分子对接中，常用的评分函数有哪些类型？并简述其原理。

3.简述蛋白质结构域的概念及其在药物靶点识别中的意义。

4.列举至少三种常用的生物信息学数据库，并说明其主要用途。

三、论述题（每题10分，共30分）

1.论述生物信息学技术在药物靶点识别与验证过程中的作用和应用。

2.试述分子对接技术在现代药物设计中的优势、局限性以及如何改进预测结果的可信度。

3.结合具体实例（可假设），阐述如何综合运用QSAR模型和ADMET预测结果来评价一个虚拟筛选得到的候选化合物。

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试卷答案

一、选择题

1.C

2.C

3.C

4.B

5.D

6.D

7.C

8.B

9.D

10.C

二、简答题

1.答案：虚拟筛选通常包括以下步骤：首先，获取目标靶点蛋白质的三维结构（常来自PDB数据库）；其次，准备一个包含大量化合物（候选药物分子）的结构数据库；然后，利用分子对接软件，将数据库中的化合物分子逐一或批量地与靶点蛋白结构进行结合模拟，计算它们之间的相互作用能或评分；最后，根据计算得到的评分或排序结果，筛选出得分较高、与靶点结合较强的候选分子，作为后续实验研究的对象。

解析思路：考察对虚拟筛选核心流程的理解。需要掌握流程的起始（靶点结构、化合物库）、核心步骤（分子对接模拟与评分）和最终目的（筛选候选分子）。回答需包含关键环节和参与元素。

2.答案：常用的分子对接评分函数类型主要有：绝对评分函数和相对评分函数。绝对评分函数旨在预测结合自由能（ΔG结合）等真实thermodynamic参数，如AutoDock的AD4函数、Schrodinger的Glide系列函数。相对评分函数主要判断分子之间结合能力的相对顺序，不直接预测绝对能量值，计算速度通常更快，如GOLD的DOCKScorer函数。

解析思路：考察对分子对接核心工具（评分函数）的分类和原理理解。需要知道存在不同类型的评分函数，并能举例说明其区别和主要代表。理解绝对评分和相对评分在预测