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2025年Hi-C数据三维基因组结构分析技能考核试卷
一、单项选择题(每题1分,共30题)
1.Hi-C数据主要用于研究什么?
A.DNA序列
B.蛋白质结构
C.三维基因组结构
D.基因表达
2.Hi-C数据的核心原理是什么?
A.基因测序
B.粒子加速
C.空间捕获
D.信号放大
3.Hi-C数据中,接触矩阵指的是什么?
A.DNA序列矩阵
B.蛋白质相互作用矩阵
C.空间接触频率矩阵
D.基因表达矩阵
4.Hi-C数据分析的第一步通常是什么?
A.数据质控
B.序列比对
C.蛋白质结构预测
D.基因表达分析
5.在Hi-C数据分析中,binsize指的是什么?
A.序列长度
B.空间分辨率
C.接触频率
D.数据点数
6.Hi-C数据中,连锁图(ChromosomeInteractionMap)是什么?
A.DNA序列图
B.蛋白质相互作用图
C.空间接触频率图
D.基因表达图
7.Hi-C数据中,相互作用频率通常用什么单位表示?
A.拷贝数
B.分子量
C.摩尔浓度
D.百万次接触
8.Hi-C数据分析中,热图(Heatmap)主要用于什么?
A.显示序列特征
B.显示蛋白质结构
C.显示空间接触频率
D.显示基因表达
9.Hi-C数据中,距离阈值(DistanceThreshold)是什么?
A.序列长度范围
B.空间距离范围
C.接触频率范围
D.数据点数范围
10.Hi-C数据分析中,伪近体(Paralogousregions)是什么?
A.相似的基因序列
B.相似的蛋白质结构
C.相似的基因组区域
D.相似的表达模式
11.Hi-C数据中,染色质相互作用网络(ChromosomeInteractionNetwork)是什么?
A.DNA序列网络
B.蛋白质相互作用网络
C.空间接触网络
D.基因表达网络
12.Hi-C数据分析中,接触频率矩阵的行和列分别代表什么?
A.基因和蛋白质
B.DNA序列和蛋白质结构
C.基因组区域和空间位置
D.基因表达和蛋白质相互作用
13.Hi-C数据中,三维基因组结构通常用什么方法可视化?
A.折线图
B.散点图
C.三维结构图
D.热图
14.Hi-C数据分析中,连锁图的主要目的是什么?
A.显示序列特征
B.显示蛋白质结构
C.显示空间接触频率
D.显示基因表达
15.Hi-C数据中,距离阈值的设定对分析结果有什么影响?
A.增加数据量
B.减少数据量
C.提高分辨率
D.降低分辨率
16.Hi-C数据分析中,伪近体的识别方法是什么?
A.序列比对
B.蛋白质结构预测
C.空间接触分析
D.基因表达分析
17.Hi-C数据中,染色质相互作用网络的构建方法是什么?
A.序列比对
B.蛋白质结构预测
C.空间接触分析
D.基因表达分析
18.Hi-C数据分析中,接触频率矩阵的标准化方法是什么?
A.Z-score标准化
B.Min-Max标准化
C.基因表达标准化
D.蛋白质结构标准化
19.Hi-C数据中,三维基因组结构的研究意义是什么?
A.揭示基因组组织
B.研究基因表达
C.预测蛋白质结构
D.分析DNA序列
20.Hi-C数据分析中,连锁图的绘制工具是什么?
A.Excel
B.R
C.Python
D.MATLAB
21.Hi-C数据中,距离阈值的设定依据是什么?
A.数据量
B.空间分辨率
C.接触频率
D.基因表达
22.Hi-C数据分析中,伪近体的识别意义是什么?
A.揭示基因组重复
B.研究基因表达
C.预测蛋白质结构
D.分析DNA序列
23.Hi-C数据中,染色质相互作用网络的应用领域是什么?
A.基因组学研究
B.蛋白质组学研究
C.转录组学研究
D.代谢组学研究
24.Hi-C数据分析中,接触频率矩阵的稀疏性是什么?
A.数据量少
B.相互作用少
C.空间距离远
D.基因表达低
25.Hi-C数据中,三维基因组结构的研究方法是什么?
A.测序技术
B.结构生物学
C.计算生物学
D.细胞生物学
26.Hi-C数据分析中,连锁图的应用意义是什么?
A.揭示基因组组织
B.研究基因表达
C.预测蛋白质结构
D.分析DNA序列
27.Hi-C数据中,距离阈值的优化方法是什么?
A.交叉验证
B.网格搜索
C.贝叶斯优化
D.遗传算法
28.Hi-C数据分析中,伪近体的去除方法是什么?
A.序列比对
B.蛋白质结构预测
C.空间接触分析
D.基因表达分析
29.Hi-C数据中,染色质相互作用网络的动态变化是什么?
A.基因组结构变化
B.蛋白质结构变化
C.基因表达变化
D.细胞状态变化
30.Hi-C数据中,三维基因组结构的未来发展方向是什么?
A.更高的分辨率
B.更多的样本
C.更深入的研究
D.更广泛的应用
二、多项选择题(每题2分,共20题)
1.
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