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2025年大学《整合科学》专业题库——细胞信号转导路径的计算建模研究
考试时间:______分钟总分:______分姓名:______
一、选择题(每题2分,共20分)
1.下列哪一项不属于细胞信号转导过程中常见的信号分子类型?
A.激素
B.神经递质
C.局部介质
D.细胞外基质成分
2.在细胞信号转导中,充当第一信使并将其信息传递给细胞内第二信使系统的受体通常是?
A.G蛋白偶联受体
B.细胞膜受体酪氨酸激酶
C.酪氨酸激酶受体
D.内吞作用受体
3.下列哪个模型主要描述系统随时间变化的平均行为,适用于分子浓度较高且碰撞频繁的情况?
A.斯特普罗过程(StochasticProcess)
B.基于网络的模型
C.常微分方程(ODE)模型
D.离散事件模型
4.在常微分方程(ODE)模型中,`d[分子]/dt=k*[底物]/([底物]+Kd)`描述了一个典型的?
A.简单扩散过程
B.受体与配体结合
C.酶促反应速率
D.蛋白质降解过程
5.细胞信号通路中,负反馈调节的主要作用是?
A.增强信号传递的灵敏度
B.使信号快速衰减,防止过度反应
C.延长信号持续时间
D.增加信号传递途径的复杂性
6.评估一个计算模型能否准确反映真实系统行为的关键步骤是?
A.模型参数的敏感性分析
B.模型结果的数学优美性
C.模型能否通过简单的数学推导
D.模型与实验数据的拟合程度
7.对于一个描述信号通路中两个中间产物A和B相互转化的简单ODE模型`d[A]/dt=-k1[A]+k2[B]`,`d[B]/dt=k1[A]-k2[B]`,其稳态解(平衡点)是?
A.A=0,B=0
B.A=K1,B=K2
C.A=B
D.A=k1/k2,B=k1/k2
8.敏感性分析的主要目的是确定模型输出对哪些输入参数变化最为敏感?
A.通过数学公式推导出参数关系
B.评估模型在不同条件下的行为稳定性
C.找出模型中可能存在的错误或缺陷
D.优化模型参数以提高计算效率
9.整合生物学视角下,计算建模信号转导通路的主要价值在于?
A.精确预测单个分子的行为
B.理解系统层面的动态行为和调控网络
C.直接替代实验研究
D.发现新的信号分子
10.将基因表达数据、蛋白质浓度数据和代谢物浓度数据整合到同一个计算模型中,属于哪种建模策略?
A.单尺度建模
B.多尺度建模
C.减量建模
D.简化建模
二、填空题(每空1分,共15分)
1.细胞信号转导的基本过程通常包括______、______、______和______四个主要步骤。
2.常见的细胞内第二信使包括______、______和钙离子等。
3.构建常微分方程(ODE)模型时,模型参数通常需要通过______或______获得。
4.判断模型中一个平衡点是否稳定,通常需要计算该点处的______,并判断其符号。
5.在信号转导通路计算建模中,______分析有助于理解模型对参数变化的敏感程度。
6.基于网络的模型可以用来描述信号转导通路中各个组分之间的______关系。
7.计算建模在整合科学中的作用之一是能够模拟不同______和______层面信息的相互作用。
8.模型假设是构建模型的基础,但也是模型的______,需要谨慎对待。
三、简答题(每题5分,共20分)
1.简述受体酪氨酸激酶(RTK)信号通路的基本传导过程及其关键调控点。
2.解释什么是计算建模中的模型参数?请列举至少三种在细胞信号转导模型中常见的参数及其生物学意义。
3.简述常微分方程(ODE)模型在描述细胞信号转导过程中的优势与局限性。
4.为什么在整合科学框架下研究细胞信号转导的计算建模具有重要意义?
四、计算题(共25分)
1.(10分)考虑一个简单的细胞信号转导模型,其中信号分子X与细胞表面受体R结合形成复合物XR,复合物XR发生磷酸化变为激活的复合物X-P,激活的X-P随后激活下游效应蛋白Y。假设结合和磷酸化过程是限速步骤,其速率常数分别为k1、k2,X-P的降解速率为k3。请:
a.建立描述该信号通路中[X]、[R]、[XR]和[X-P]浓度的常微分方程(ODE)模
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