2025年大学《整合科学》专业题库—— 基因调控网络的计算建模研究.docxVIP

2025年大学《整合科学》专业题库——基因调控网络的计算建模研究

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、选择题（每题2分，共20分）

1.下列哪一项不属于基因调控网络的组成要素？

A.调控蛋白

B.操纵子

C.调控子

D.转录终止子

2.在基因调控网络中，一个基因产物（如蛋白质）同时调控多个基因的表达，这种现象称为：

A.基序调控

B.负反馈调控

C.调控子调控

D.多重调控

3.逻辑斯蒂模型（LogisticModel）常用于描述基因表达调控中的什么现象？

A.调控蛋白与靶基因的结合

B.基因表达产物对自身表达的抑制作用

C.基因表达水平随环境因素的变化而饱和

D.噪声对基因表达的影响

4.下列哪种方法属于基于实验数据驱动构建的计算模型？

A.布尔网络建模

B.基于物理基础的建模

C.机理建模

D.基于基因表达时间序列的模型

5.在基因调控网络计算建模中，稳态通常指的是：

A.网络达到的最大表达水平

B.网络内部状态不随时间发生变化的平衡点

C.网络中基因表达量剧烈波动的状态

D.网络响应外部刺激后的瞬时状态

6.以下哪种数学工具常用于描述基因调控网络中连续变化的浓度或数量？

A.逻辑门（AND,OR,NOT）

B.概率图模型

C.微分方程

D.状态空间图

7.正反馈回路在基因调控网络中主要起到什么作用？

A.稳定网络状态

B.抑制下游基因表达

C.促进特定条件下网络状态的快速变化或放大信号

D.减少网络中的噪声

8.SBML（SystemsBiologyMarkupLanguage）的主要作用是：

A.直接执行计算模型

B.规范描述计算模型的语言

C.替代实验进行生物学研究

D.自动设计基因调控实验

9.基因调控网络计算建模的主要目标之一是：

A.完全精确地复制所有实验观测

B.理解网络结构和功能，预测网络行为

C.发现网络中所有基因的物理位置

D.开发治愈所有遗传疾病的药物

10.下列哪项技术通常不直接用于基因调控网络计算建模的数据来源？

A.基因芯片（Microarray）数据分析

B.RNA测序（RNA-seq）数据分析

C.蛋白质组学数据

D.基因敲除实验结果

二、填空题（每空1分，共15分）

1.基因调控网络的核心在于理解基因之间的______关系及其动态变化。

2.计算建模为研究复杂的基因调控网络提供了______和______的强大工具。

3.在布尔网络中，节点状态通常表示为______或______两种状态。

4.微分方程模型能够描述系统中各组分随______的变化率，通常需要确定模型参数。

5.基因调控网络中的______是指网络行为对初始条件或参数的敏感依赖性。

6.诱导型相互作用是指上游基因产物促进下游基因的______。

7.负反馈回路通过抑制上游节点的产生或活性，使得网络状态趋于______。

8.评估计算模型性能的常用指标包括______、______和______。

9.随机过程模型（如马尔可夫链）适用于描述基因调控网络中存在的______和______。

10.将多种类型的数据（如基因表达和蛋白质相互作用）整合到计算模型中称为______建模。

三、简答题（每题5分，共20分）

1.简述基因调控网络计算建模的主要步骤。

2.比较确定性模型（如微分方程模型）和随机模型（如随机过程模型）在描述基因调控网络行为上的主要区别和适用场景。

3.解释什么是基因调控网络的“噪声”，并简述噪声产生的主要来源。

4.简述构建基因调控网络计算模型时，选择特定建模方法需要考虑的因素。

四、计算与分析题（共25分）

1.（10分）考虑一个简单的基因调控负反馈回路：基因A的表达产物（蛋白P）可以抑制基因A自身的启动子活性。假设基因A的转录速率与其启动子活性成正比（α*Promoter活性），蛋白P的合成速率与基因A的转录速率成正比（k1*α*Promoter活性），蛋白P的降解速率为常数k2。请：

(1)写出描述该系统行为的简化微分方程模型（假设蛋白P是主要的调控分子，忽略其与启动子的直接结合动力学，且Promoter活性可近似看作基因表