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DB53T12018香蕉枯萎病PCR检测技术规程
1范围
本标准规定了香蕉枯萎病(Fusariumwiltofbanana)PCR检测的原理、试剂与材料、仪器设备、样品采集与处理、DNA提取、PCR反应体系、PCR反应程序、结果判定及废弃物处理等技术要求。
本标准适用于香蕉植株、土壤及其他可能携带香蕉枯萎病菌(Fusariumoxysporumf.sp.cubense)的样品中病原菌的PCR检测。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
GB19489实验室生物安全通用要求
SN/T2122进出境植物检疫实验室生物安全操作规范
3术语和定义
下列术语和定义适用于本标准。
3.1香蕉枯萎病Fusariumwiltofbanana
由尖孢镰刀菌古巴专化型(Fusariumoxysporumf.sp.cubense)侵染引起的香蕉维管束系统性病害,又称巴拿马病。
3.2PCR聚合酶链式反应PolymeraseChainReaction
一种体外酶促合成特异性DNA片段的方法,由高温变性、低温退火和适温延伸三个步骤组成的热循环过程。
3.3引物Primer
与待扩增DNA片段两端互补的寡核苷酸序列,用于引导DNA合成。
3.4阳性对照Positivecontrol
含有已知目标DNA序列的样品,用于验证PCR反应体系的可靠性。
3.5阴性对照Negativecontrol
不含目标DNA序列的样品,用于检测PCR反应过程中是否存在污染。
4原理
本标准基于香蕉枯萎病菌(Fusariumoxysporumf.sp.cubense)特异性DNA序列设计引物,通过PCR技术对样品中可能存在的病原菌DNA进行扩增检测。PCR反应过程中,引物与目标DNA序列特异性结合,在TaqDNA聚合酶的作用下,经过变性、退火和延伸的循环过程,特异性扩增目标片段。通过电泳检测扩增产物,根据预期片段大小判断样品中是否含有香蕉枯萎病菌。
5试剂与材料
5.1主要试剂
5.1.1无DNA酶的蒸馏水或超纯水(GB/T6682,一级水)
5.1.210×PCR缓冲液(含Mg2?)
5.1.3dNTP混合液(各2.5mmol/L)
5.1.4TaqDNA聚合酶(5U/μL)
5.1.5上游引物(10μmol/L):5GGCCTCCAAAGGGTAATCA3
5.1.6下游引物(10μmol/L):5CGGTTTGAACGTCACTTGAC3
5.1.7DNA分子量标准(100bpDNALadder)
5.1.8琼脂糖
5.1.950×TAE电泳缓冲液
5.1.10溴化乙锭(EB)或其他核酸染料
5.1.11液氮
5.1.12CTAB提取缓冲液:2%CTAB,100mmol/LTrisHCl(pH8.0),20mmol/LEDTA(pH8.0),1.4mol/LNaCl
5.1.13氯仿:异戊醇(24:1)
5.1.14异丙醇
5.1.1570%乙醇
5.2主要材料
5.2.1PCR反应管(0.2mL或0.5mL)
5.2.2微量移液器吸头(10μL、200μL、1000μL)
5.2.3离心管(1.5mL、2.0mL)
5.2.4研钵和研杵
5.2.5电泳槽和电泳仪
5.2.6紫外凝胶成像系统
5.2.7恒温水浴锅
5.2.8高速冷冻离心机
5.2.9PCR扩增仪
5.2.10微量移液器(0.510μL、10100μL、1001000μL)
5.2.11电子天平(精度0.001g)
5.2.12pH计
5.2.13灭菌蒸馏水
5.2.14医用纱布
5.2.15无菌手术刀
5.2.16一次性手套
5.2.17口罩
5.2.18实验服
6仪器设备
6.1PCR扩增仪:温度控制精度±0.5℃,升降温速率≥2.0℃/秒。
6.2高速冷冻离心机:最高转速≥15000r/min,温度控制范围20℃~40℃。
6.3电泳仪:输出电压0~300V可调,输出电流0~500mA可调。
6.4紫外凝胶成像系统:波长302nm,分辨率≥300万像素。
6.5微量移液器:量程0.5~10μL、10~100μL、100~1000μL,精度±1.5%。
6.6电子天平:量程0~200g,精度0.001g。
6.7恒温水浴锅:温度控制范围室温~100℃,精度±0.5℃
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