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虚拟筛选试卷及答案

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、选择题（每题2分，共20分。请将正确选项字母填入括号内）

1.在生物信息学中，虚拟筛选通常指的是什么过程？

(A)通过计算预测蛋白质的三维结构

(B)在大规模数据库中搜索与已知活性分子结构相似的化合物

(C)对基因表达数据进行统计分析

(D)通过实验方法筛选具有特定活性的化合物

2.以下哪种算法通常用于序列比对，是许多序列数据库搜索算法的基础？

(A)k-mer匹配

(B)贝叶斯推理

(C)动态规划

(D)机器学习

3.当使用BLAST进行序列相似性搜索时，选择“highlysimilarsequences”和“gapsareallowed”选项，最有可能得到什么样的搜索结果？

(A)与查询序列同源性非常高的序列，允许存在插入缺失

(B)与查询序列同源性较低的序列，不允许存在插入缺失

(C)与查询序列同源性非常高的序列，不允许存在插入缺失

(D)与查询序列同源性较低的序列，允许存在插入缺失

4.FASTA算法与BLAST算法相比，其主要优势通常在于？

(A)搜索速度更快，尤其是在大数据库中

(B)能够找到更远缘的序列相似性

(C)结果报告更详细，包含更多统计信息

(D)更适合进行多序列比对

5.在BLAST结果报告中，E-value（期望值）的含义是什么？

(A)查询序列的长度

(B)查询序列与数据库中随机序列的预期匹配数

(C)查询序列与目标序列之间的相似度得分

(D)找到当前匹配所需的计算时间

6.PDB（蛋白质数据银行）主要存储什么类型的数据？

(A)原始基因测序数据

(B)蛋白质和核酸的序列信息

(C)已解析的蛋白质和核酸的三维结构

(D)基因表达调控元件

7.虚拟筛选中，使用“分子对接”（MolecularDocking）技术的主要目的是什么？

(A)预测蛋白质的二级结构

(B)预测化合物的吸收、分布、代谢和排泄（ADME）性质

(C)计算化合物与靶点蛋白质结合的亲和力并预测结合模式

(D)比较不同化合物的序列相似性

8.以下哪项不是常见的用于虚拟筛选的化合物数据库？

(A)ZINC

(B)ChEMBL

(C)GenBank

(D)PubChem

9.在进行基于结构的虚拟筛选时，通常需要靶点蛋白质的什么信息？

(A)基因序列

(B)mRNA序列

(C)三维结构坐标

(D)转录因子结合位点

10.虚拟筛选结果需要进行验证的原因是什么？

(A)虚拟筛选软件本身存在错误

(B)计算机硬件资源有限

(C)预测的活性或结合模式需要通过实验进行确认

(D)数据库中的序列信息可能不完整

二、填空题（每题2分，共20分。请将答案填入横线处）

1.序列比对的目标通常是找到两个或多个序列之间的__________，以便揭示它们的进化关系或功能相似性。

2.BLAST（基本局部对齐搜索工具）的全称是__________。

3.FASTA算法中使用的k-mer是指序列中连续的__________个核苷酸或氨基酸。

4.PDB的官方网站地址是__________（请填写常用地址）。

5.分子对接技术通常需要输入化合物的__________和靶点蛋白质的__________。

6.虚拟筛选是药物发现流程中常用的一种__________技术，旨在从大量化合物中快速识别潜在的活性分子。

7.评估虚拟筛选结果好坏的一个常用指标是__________，它反映了假阳性的比例。

8.基于结构的虚拟筛选（Structure-BasedVirtualScreening,SBVS）主要利用已知__________的蛋白质结构进行筛选。

9.在虚拟筛选中，将筛选得到的候选化合物列表进行进一步的__________分析，如统计分析、化学性质筛选等，以减少后续实验验证的数目。

10.常用的虚拟筛选软件或平台包括AutoDock,Glide,__________等。

三、简答题（每题5分，共15分）

1.简述BLAST搜索的基本步骤。

2.解释什么是“配对得分矩阵”（PairwiseScoringMatrix）在序列比对中的作用。

3.列举至少三种虚拟筛选可能产