林木低温胁迫 iceA 基因表达 RNA-seq 差异分析完整代码开源试题库及答案.docVIP

林木低温胁迫iceA基因表达RNA-seq差异分析完整代码开源试题库及答案

一、单项选择题（每题2分，共10题）

1.RNA-seq技术主要用于分析（）

A.蛋白质表达B.DNA序列C.基因转录水平D.细胞代谢产物

答案：C

2.低温胁迫下对iceA基因研究，可直接获取其（）

A.功能B.表达量变化C.突变情况D.启动子序列

答案：B

3.以下哪种工具常用于RNA-seq数据分析（）

A.PhotoshopB.R语言C.WordD.Excel

答案：B

4.分析RNA-seq差异表达基因一般设定的显著水平是（）

A.0.01B.0.05C.0.1D.0.2

答案：B

5.对iceA基因进行RNA-seq分析前，样本需进行（）

A.纯化B.染色C.离心D.破碎

答案：A

6.RNA-seq文库构建的关键步骤是（）

A.加样B.测序C.反转录D.清洗

答案：C

7.低温胁迫实验设置的重复次数一般为（）

A.1次B.2次C.3次及以上D.随意

答案：C

8.检测RNA完整性的指标是（）

A.OD值B.RIN值C.pH值D.浓度值

答案：B

9.进行RNA-seq数据分析时，参考基因组的作用是（）

A.计算误差B.比对序列C.确定温度D.标记基因

答案：B

10.以下不属于RNA-seq差异分析软件的是（）

A.DESeq2B.edgeRC.SPSSD.limma

答案：C

二、多项选择题（每题2分，共10题）

1.RNA-seq技术的优点有（）

A.可检测低丰度转录本B.定量准确C.能发现新转录本D.操作简单

答案：ABC

2.低温胁迫对林木可能产生的影响有（）

A.细胞膜损伤B.酶活性改变C.基因表达变化D.植株死亡

答案：ABCD

3.构建RNA-seq文库所需的试剂有（）

A.反转录酶B.引物C.dNTPD.限制性内切酶

答案：ABC

4.分析iceA基因表达差异，需要考虑的因素有（）

A.低温处理时间B.样本采集部位C.测序深度D.对照设置

答案：ABCD

5.用于RNA-seq数据质量评估的指标有（）

A.测序碱基质量B.比对率C.插入片段大小D.基因覆盖度

答案：ABD

6.以下属于生物信息学工具的有（）

A.BLASTB.FastQCC.TrinityD.PrimerPremier

答案：ABCD

7.低温胁迫实验设计时，需要设置（）

A.不同低温梯度B.不同处理时间C.不同林木品种D.不同湿度条件

答案：AB

8.RNA-seq数据比对到参考基因组后可进行的分析有（）

A.基因表达定量B.可变剪接分析C.基因注释D.差异表达分析

答案：ABD

9.影响iceA基因表达的因素可能有（）

A.转录因子调控B.环境温度变化C.自身启动子活性D.细胞分化程度

答案：ABC

10.开源的RNA-seq数据分析工具的优势有（）

A.免费使用B.持续更新C.社区支持D.功能强大

答案：ABCD

三、判断题（每题2分，共10题）

1.RNA-seq只能检测已知基因的表达。（）

答案：错

2.低温胁迫一定会导致iceA基因表达量上升。（）

答案：错

3.构建RNA-seq文库时，RNA质量对结果影响不大。（）

答案：错

4.R语言是唯一可用于RNA-seq数据分析的语言。（）

答案：错

5.差异表达分析结果中的基因都是有功能意义的。（）

答案：错

6.测序深度越高，RNA-seq数据质量一定越好。（）

答案：错

7.低温胁迫实验中，不需要设置对照样本。（）

答案：错

8.可以直接用原始RNA-seq测序数据进行差异分析。（）

答案：错

9.分析iceA基因表达，只需要关注低温处理组数据。（）

答案：错

10.开源代码在使用过程中不需要遵循任何协议。（）

答案：错

四、简答题（每题5分，共4题）

1.简述RNA-seq技术流程。

答案：提取RNA，检测质量，反转录成cDNA，构建文库，测序，数据质量评估