林木 CRISPRon ChIP-seq 峰值注释 homer 与 deeptools 流程容器化试题库及答案.docVIP

林木CRISPRonChIP-seq峰值注释homer与deeptools流程容器化试题库及答案

一、单项选择题（每题2分，共10题）

1.CRISPRon主要用于？

A.基因敲除B.基因激活C.基因编辑D.基因沉默

答案：B

2.ChIP-seq技术的主要目的是？

A.检测DNA甲基化B.分析基因表达C.确定蛋白与DNA结合位点D.测序全基因组

答案：C

3.homer工具可用于？

A.序列比对B.峰值注释C.数据可视化D.质量控制

答案：B

4.deeptools不能进行以下哪项操作？

A.信号强度分析B.样本聚类C.引物设计D.可视化

答案：C

5.容器化技术的优势不包括？

A.环境一致性B.资源隔离C.增加系统复杂性D.便于部署

答案：C

6.以下哪种是常用的容器化工具？

A.PythonB.DockerC.RD.Java

答案：B

7.ChIP-seq实验中，抗体的作用是？

A.标记DNAB.沉淀目标蛋白-DNA复合物C.扩增DNAD.修饰蛋白

答案：B

8.CRISPRon依赖的关键元件是？

A.Cas9B.gRNAC.激活结构域D.以上都是

答案：C

9.峰值注释是为了？

A.确定基因位置B.找到蛋白结合位点C.了解调控元件功能D.评估测序质量

答案：C

10.流程容器化有助于？

A.提高数据分析效率B.增加数据量C.降低数据准确性D.减少计算资源

答案：A

二、多项选择题（每题2分，共10题）

1.以下属于ChIP-seq实验步骤的有（）

A.细胞交联B.超声破碎C.免疫沉淀D.文库构建E.测序

答案：ABCDE

2.关于CRISPRon正确的是（）

A.可特异性激活基因B.需特定载体C.依赖核酸酶活性D.可用于基因功能研究E.只能在植物中应用

答案：ABD

3.homer可进行的注释类型有（）

A.基因注释B.转录因子结合位点注释C.启动子注释D.增强子注释E.内含子注释

答案：ABCD

4.deeptools能进行的分析有（）

A.覆盖度分析B.热图绘制C.富集分析D.相关性分析E.差异表达分析

答案：ABCD

5.容器化的好处包括（）

A.快速部署B.版本控制C.跨平台使用D.降低维护成本E.提高数据安全性

答案：ABCD

6.进行ChIP-seq实验需要准备的材料有（）

A.抗体B.细胞样本C.磁珠D.缓冲液E.测序仪

答案：ABCD

7.与CRISPR/Cas9基因编辑技术相关的有（）

A.基因敲除B.基因敲入C.基因激活D.基因沉默E.单碱基编辑

答案：ABCDE

8.峰值注释可借助的数据库有（）

A.EnsemblB.RefSeqC.GeneBankD.KEGGE.GO

答案：ABCE

9.常用的容器编排工具包括（）

A.KubernetesB.MesosC.DockerComposeD.JenkinsE.GitLab

答案：ABC

10.影响ChIP-seq实验结果的因素有（）

A.抗体质量B.超声条件C.免疫沉淀效率D.测序深度E.样本处理

答案：ABCDE

三、判断题（每题2分，共10题）

1.CRISPRon只能激活内源基因。（）

答案：错

2.ChIP-seq可以直接检测到基因表达水平。（）

答案：错

3.homer只能用于峰值注释，不能进行其他分析。（）

答案：错

4.deeptools可以在没有测序数据的情况下使用。（）

答案：错

5.容器化后，数据分析流程的运行效率一定会提高。（）

答案：错

6.构建ChIP-seq文库不需要进行PCR扩增。（）

答案：错

7.CRISPRon技术不需要gRNA引导。（）

答案：错

8.峰值注释能完全确定调控元件的功能。（）

答案：错

9.任何数据分析流程都适合进行容器化。（）

答案：错

10.抗体的特异性不影响ChIP-seq实验结果。（）

答案：错

四、简答题（每题5分，共4题）

1.简述ChIP-seq实验原理。