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基于SSR标记的陕西省玉米遗传多样性解析与育种启示

一、引言

1.1研究背景与意义

玉米（ZeamaysL.）作为全球重要的粮食、饲料及工业原料作物，在农业生产与国民经济中占据关键地位。我国是世界第二大玉米生产国，玉米种植面积广泛，总产量在粮食总产量中占比颇高，对保障国家粮食安全起着举足轻重的作用。陕西省地处我国内陆，拥有多样的地形地貌与气候条件，为玉米种植提供了得天独厚的自然环境，是我国重要的玉米产区之一。其玉米种植历史悠久，种植区域涵盖陕北、关中和陕南三大地理区域，种植面积常年稳定在一定规模，产量也在全国占据重要位置，为陕西省的农业经济发展和农民增收做出了重要贡献。例如，黄龙县作为典型农业县，玉米种植面积、总产量位居全省前列，亩产量位居延安第一。在粮食安全备受关注的当下，玉米生产的稳定与发展显得尤为重要。

遗传多样性是物种进化、适应环境变化以及品种改良的基础，对玉米而言，丰富的遗传多样性意味着拥有更多可供选择的优良基因，这不仅有助于玉米品种抵御各种生物和非生物胁迫，如病虫害、干旱、高温等，还能为培育高产、优质、多抗的玉米新品种提供坚实的物质基础。对玉米遗传多样性进行深入研究，在玉米育种和种业发展中具有不可替代的关键作用。一方面，在育种实践中，了解不同玉米自交系和杂交种的遗传多样性，能够帮助育种者更加科学、精准地选择亲本，避免因亲本遗传背景狭窄而导致杂种优势不明显的问题，从而提高杂交种的选育效率，培育出具有更强杂种优势、更高产量和更好品质的玉米新品种。另一方面，对于种业发展来说，遗传多样性研究结果可以为种子纯度鉴定、品种权保护提供有力的技术支持，防止假冒伪劣种子流入市场，维护种业市场的正常秩序，保障育种者和农民的合法权益。此外，明晰玉米种质资源的遗传多样性，还有助于合理开发和利用现有种质资源，挖掘新的优良基因，拓宽玉米的遗传基础，推动玉米种业的可持续发展。

1.2国内外研究现状

分子标记技术的迅猛发展，为玉米遗传多样性分析提供了强大的技术支撑。简单序列重复（SSR）标记，作为第二代分子标记技术，凭借其多态性高、重复性好、共显性遗传、操作简便等诸多优点，在玉米遗传多样性研究领域得到了广泛的应用。

在国外，科研人员利用SSR标记对玉米遗传多样性开展了大量研究。例如，部分学者对来自不同地区的玉米种质资源进行了遗传多样性分析，通过筛选多态性丰富的SSR引物，对大量玉米自交系和杂交种进行检测，揭示了不同玉米种质之间的亲缘关系和遗传差异，为玉米种质资源的引进、改良和利用提供了重要的理论依据。还有研究利用SSR标记构建玉米指纹图谱，实现了对玉米品种的快速、准确鉴定，有效保护了玉米品种的知识产权。

在国内，众多科研团队也积极运用SSR标记技术开展玉米遗传多样性相关研究。王凤格等人运用SSR标记对中国328个玉米品种（组合）进行遗传多样性分析，检测到丰富的等位基因变异，明确了不同品种间的遗传相似系数，为我国玉米品种的分类和种质创新提供了参考。肖木辑等人对高淀粉玉米自交系进行SSR标记遗传多样性分析，为高淀粉玉米品种的选育和改良提供了理论基础。在陕西省，赵静等人从100对玉米SSR引物中选取29对扩增带型清晰、多态性较高的引物，对陕西省26个玉米主栽品种的遗传多样性进行分析，检测到148个等位基因变异，聚类分析结果与品种系谱分析基本吻合，初步揭示了陕西省部分玉米主栽品种的遗传多样性情况。然而，目前针对陕西省主要玉米自交系和杂交种的SSR遗传多样性分析研究还相对较少，且存在研究材料不够全面、引物筛选不够系统、分析方法不够深入等问题，无法全面、深入地揭示陕西省玉米种质资源的遗传多样性特点和规律，难以满足陕西省玉米育种和种业发展的实际需求。

1.3研究目标与内容

本研究旨在运用SSR标记技术，深入解析陕西省主要玉米自交系和杂交种的遗传多样性，为陕西省玉米种质资源的合理利用、品种选育以及种业发展提供坚实的理论依据和技术支持。具体研究内容如下：

材料选择：广泛收集陕西省不同地区、不同育种单位选育的具有代表性的玉米自交系和主推杂交种作为研究材料，确保研究材料能够涵盖陕西省玉米种质资源的主要类型和遗传背景，保证研究结果的全面性和代表性。

标记分析：从已公布的玉米SSR引物中，系统筛选出扩增效果好、多态性高的引物，对所选玉米材料的基因组DNA进行PCR扩增，通过聚丙烯酰胺凝胶电泳或毛细管电泳等方法，准确检测扩增产物的多态性，获取丰富的遗传信息。

多样性评估：运用相关软件对检测到的SSR标记数据进行统计分析，计算等位基因数、有效等位基因数、基因多样性指数、多态性信息含量等遗传多样性参数，全面评估陕西省主要玉米自交系和杂交种的遗传多样性水平。同时，通过聚类分析、主成分分析等方法，明