基于基因表达和DNA甲基化的骨关节炎生物标志物分析.pdfVIP

2025年7月内蒙古大学学报（自然科学版）Jul.2025

第56卷第4期JournalofInnerMongoliaUniversity(NaturalScienceEdition)Vol.56No.4

文章编号：1000-1638（2025）04-0376-13DOI：10.13484/j.nmgdxxbzk.

基于基因表达和DNA甲基化的骨关节炎

生物标志物分析∗

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孙建业，樊国梁，张晓炜

（1.内蒙古大学物理科学与技术学院，呼和浩特010021；

2.内蒙古医科大学第一附属医院风湿免疫科，呼和浩特010050）

摘要：骨关节炎（Osteoarthritis，OA）是一种慢性退行性疾病，涉及软骨、滑膜组织炎症，致残

率和发病率都高。研究发现，骨关节炎的发病机制可能涉及众多分子和信号通路，本研究筛选

患有骨关节炎和正常人的滑膜组织表达谱数据集和DNA甲基化数据集，通过差异表达基因

（Differentiallyexpressedgenes，DEGs）和差异甲基化基因（Differentiallymethylatedgenes，

DMGs）选出145个显著相关的重要基因，进行GO（Geneontology）和KEGG（Kyotoencyclope‐

diaofgenesandgenomes）富集分析。通过PPI（Protein-proteininteraction）网络分析和相关性

计算筛选出5个hub基因，ROC曲线显示其在OA中具有良好的诊断性能，可以作为早期诊断

治疗的潜在生物标志物。进一步构建了ceRNA网络，发现了与其中两个hub基因COL1A1、

NR4A2密切相关的miRNA和circRNA，通过circRNA-miRNA-mRNA调控网络发现了一些

circRNA，可以成为OA诊断和治疗的重要靶点。

关键词：骨关节炎；基因表达；DNA甲基化；关键基因；ceRNA网络

中图分类号：Q354文献标志码：A

骨关节炎（Osteoarthritis，OA）的临床表现具有显著的异质性，其典型症状包括手、膝、髋及脊柱

等关节的疼痛、功能障碍和结构畸形，这些症状不仅严重降低了患者的生活质量，还对社会经济造成

了沉重的负担。近年来，研究揭示滑膜组织中Dkk3、OSM和ADAM12等基因的异常表达与OA的

［1-3］

病理发展存在紧密联系。同时，众多研究者借助生物信息学的方法，构建了OA相关的分子互作

网络，为揭示其发病机制提供了新的研究方向。

在表观遗传学领域，DNA甲基化作为调控基因表达的关键机制，参与多种生物学过程。研究者

通过整合基因表达谱与DNA甲基化数据，发现特定基因的甲基化修饰模式与OA进展密切相关，这

一发现为深入理解OA的分子机制研究提供了新的视角。

在分子机制的研究中，随着高通量测序技术的飞速发展，研究者发现circRNA凭借其独特的共

价闭合环状结构，通过结合RNA结合蛋白、调控基因剪接及修饰亲本基因表达等方式参与多种病理

［4-6］

过程。特别是，circRNA作为竞争性内源RNA，能够通过“分子海绵”机制调控miRNA功能，这一

［4］

作用模式在动脉粥样硬化、朊病毒病和强直性肌营养不良等疾病中已得到验证。在OA研究中，