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生物信息分析师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪个数据库主要存储核酸序列信息?
A.GenBank
B.Swiss-Prot
C.PDB
D.PubMed
答案:A
解析:GenBank是NCBI维护的核酸序列数据库(正确);Swiss-Prot是蛋白质序列数据库(B错误);PDB是蛋白质三维结构数据库(C错误);PubMed是生物医学文献数据库(D错误)。
BLAST算法的主要功能是?
A.序列从头组装
B.序列相似性搜索
C.基因表达定量
D.变异位点检测
答案:B
解析:BLAST(基本局部比对搜索工具)用于快速查找与查询序列相似的已知序列(正确);从头组装常用工具为Canu(A错误);基因表达定量用Salmon或Kallisto(C错误);变异检测用GATK(D错误)。
SAM格式文件的主要特点是?
A.压缩的二进制格式
B.包含比对位置及质量信息
C.仅存储原始测序读长
D.专用于蛋白质结构预测
答案:B
解析:SAM(序列比对格式)是文本格式,包含序列比对的位置、质量、匹配得分等信息(正确);压缩二进制格式是BAM(A错误);原始读长存储于FASTQ(C错误);蛋白质结构预测用AlphaFold(D错误)。
Illumina测序技术的核心原理是?
A.纳米孔电流信号识别碱基
B.边合成边测序(SBS)
C.单分子实时测序(SMRT)
D.焦磷酸测序
答案:B
解析:Illumina采用边合成边测序,通过荧光标记的dNTP掺入并读取信号(正确);纳米孔是OxfordNanopore技术(A错误);SMRT是PacBio技术(C错误);焦磷酸测序是454技术(D错误)。
GWAS研究的主要目的是?
A.鉴定单基因遗传病致病基因
B.分析肿瘤体细胞突变
C.关联复杂性状与遗传变异
D.预测蛋白质三维结构
答案:C
解析:全基因组关联分析(GWAS)通过大规模样本关联常见变异与复杂性状(如身高、糖尿病)(正确);单基因病研究用家系连锁分析(A错误);肿瘤突变分析用外显子测序(B错误);结构预测用AlphaFold(D错误)。
以下哪个工具常用于三代测序数据的基因组组装?
A.BWA
B.Canu
C.HISAT2
D.DESeq2
答案:B
解析:Canu是专门针对长读长(如PacBio、Nanopore)的组装工具(正确);BWA和HISAT2是比对工具(A、C错误);DESeq2是差异表达分析工具(D错误)。
RNA-seq差异表达分析中,常用的标准化方法是?
A.主成分分析(PCA)
B.TPM(转录本每百万)
C.系统发生树构建
D.曼哈顿图绘制
答案:B
解析:TPM(TranscriptsPerMillion)是RNA-seq常用的标准化方法,用于校正测序深度和基因长度(正确);PCA用于样本聚类(A错误);系统发生树用于进化分析(C错误);曼哈顿图用于GWAS结果展示(D错误)。
AlphaFold2的核心技术是?
A.同源建模
B.分子动力学模拟
C.深度学习(神经网络)
D.序列比对打分矩阵
答案:C
解析:AlphaFold2基于深度学习(Transformer架构)预测蛋白质三维结构(正确);同源建模是传统方法(A错误);分子动力学模拟用于结构优化(B错误);序列比对是基础工具(D错误)。
ChIP-seq实验的主要目的是?
A.检测基因组拷贝数变异
B.定位转录因子结合位点
C.分析非编码RNA表达
D.鉴定微生物物种组成
答案:B
解析:染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)通过抗体富集目标蛋白(如转录因子)结合的DNA片段,用于定位结合位点(正确);拷贝数变异用CNV-seq(A错误);非编码RNA分析用小RNA测序(C错误);微生物鉴定用16SrRNA测序(D错误)。
构建系统发生树时,邻接法(Neighbor-Joining)属于?
A.距离法
B.最大似然法
C.贝叶斯法
D.最大简约法
答案:A
解析:邻接法通过计算序列间遗传距离构建树,属于距离法(正确);最大似然法基于进化模型概率(B错误);贝叶斯法用后验概率(C错误);最大简约法寻找最少进化步骤(D错误)。
二、多项选择题(共10题,每题2分,共20分)(每题至少2个正确选项)
以下属于NGS(二代测序)数据预处理步骤的是?
A.质量控制(FastQC)
B.接头序列去除(Trimmomatic)
C.低质量读长过滤
D.基因组从头组装(Canu)
答案:ABC
解析:预处理包括质量评估(A)、去除接头(B)、过滤低质量读长(C);组装是后续分析步骤(D错误)。
BAM文件的特点包括?
A.二进制压缩
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