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基于分子标记技术的核桃种质遗传解析与主栽品种指纹图谱构建

一、引言

1.1研究背景与意义

核桃（JuglansregiaL.），隶属胡桃科胡桃属，作为多年生木本植物，是世界著名的四大干果之一，在经济和生态领域均扮演着关键角色。

在经济价值层面，核桃浑身是宝。核桃仁营养成分丰富，富含蛋白质、不饱和脂肪酸、多种维生素（如维生素E、核黄素等）以及钙、磷、铁等微量元素。其中，不饱和脂肪酸含量在90%以上，蛋白质含量为14%-17%，可消化率达87.2%，长期食用对人体健康大有益处，不仅能够健脑益智，对心血管健康也有积极的维护作用，因而被广泛应用于食品、保健品等领域。核桃油作为一种优质的木本食用油，以其丰富的营养和独特的风味，逐渐受到消费者的青睐，市场前景广阔；核桃木材材质优良，纹理美观，质地坚硬，是制作高档家具、工艺品以及用于航空、交通和军事工业的重要原料；核桃壳可用于制作活性炭，在环保、化工等领域发挥作用；此外，核桃还可作为重要的蜜源植物，促进养蜂业的发展，进一步拓展了其经济价值链条。据FAO（2022）统计数据显示，2022年中国种植核桃面积为40万公顷，带壳坚果产量为165.6万吨，占世界核桃总产量的48%，位居世界第一位，核桃产业已成为许多地区的支柱产业，为当地经济发展和农民增收做出了重要贡献。

从生态价值来看，核桃树具有强大的生态适应性，能在荒山、荒地、荒滩等边际土地生长，且生长迅速，根系发达，树冠庞大。其在保持水土方面功效显著，能有效减少水土流失，防止土壤侵蚀；在涵养水源上作用突出，可提高土壤的保水能力，改善区域的水资源状况；还能够吸收二氧化碳，释放氧气，净化空气，为应对气候变化贡献力量；同时，核桃林为众多野生动物提供了食物来源和栖息场所，对维护生物多样性意义重大。

然而，随着核桃产业的蓬勃发展，一系列问题也逐渐浮现。在种质资源方面，由于长期的实生繁殖和品种间的混杂，导致核桃种质资源遗传背景复杂，许多优良品种的特性难以稳定遗传，一些珍稀种质资源甚至面临丢失的风险，这对核桃产业的可持续发展构成了潜在威胁。在品种选育上，当前对核桃遗传规律的认识尚不够深入，缺乏高效的遗传分析手段，使得品种选育工作进展缓慢，难以满足市场对高品质、多抗性核桃品种的需求。在市场上，由于缺乏有效的品种鉴定方法，存在品种假冒、以次充好等现象，严重扰乱了市场秩序，损害了消费者和种植户的利益。

遗传分析能够深入揭示核桃种质资源的遗传多样性、亲缘关系和遗传结构，为种质资源的保护、利用和创新提供坚实的理论依据。通过遗传分析，可以准确筛选出具有优良性状的基因资源，加速品种选育进程，培育出更具适应性和经济价值的新品种。指纹鉴定技术则为核桃品种的快速、准确鉴别提供了有力工具，能够有效防止品种混杂和假冒，规范市场秩序，保障核桃产业的健康发展。开展核桃重要种质遗传分析及主栽品种指纹鉴定研究具有重要的现实意义，它不仅有助于深入了解核桃的遗传特性，推动核桃遗传育种理论的发展，还能为核桃产业的可持续发展提供关键的技术支持和保障。

1.2国内外研究现状

国内外学者围绕核桃种质遗传分析和指纹鉴定开展了大量研究。在遗传分析领域，早期主要借助形态学标记，通过对核桃树的树高、冠幅、叶片形状、果实大小、果壳厚度等形态特征进行观察和测量，来分析品种间的差异和遗传关系。但形态学标记易受环境因素影响，多态性较低，无法准确反映遗传多样性。随着技术的进步，细胞学标记得到应用，如染色体核型分析、染色体带型分析等，从细胞层面揭示遗传信息，然而该方法操作复杂，可提供的遗传信息有限。

如今，分子标记技术成为核桃遗传分析的主要手段。RFLP（限制性片段长度多态性）标记率先应用，通过限制性内切酶切割DNA，分析片段长度多态性，但操作繁琐、成本高。RAPD（随机扩增多态性DNA）标记利用随机引物扩增DNA，具有操作简便、快速的特点，被用于核桃品种鉴定和遗传多样性分析，不过稳定性较差。AFLP（扩增片段长度多态性）标记结合了RFLP和PCR技术的优点，多态性丰富，在核桃遗传图谱构建、遗传多样性分析中广泛应用，但技术复杂，对实验条件要求高。SSR（简单序列重复）标记以其多态性高、重复性好、共显性遗传等优势，成为目前核桃遗传分析中应用最广泛的分子标记之一，用于遗传多样性评估、亲缘关系分析、指纹图谱构建等。例如，周于波等利用SSR标记技术对四川29个核桃良种进行遗传多样性和聚类分析，11对SSR引物共检测到121个基因型和80个等位基因，平均每个位点7.273个等位基因和11个基因型，为四川核桃品种的遗传研究提供了重要数据。

在指纹鉴定方面，SSR标记同样发挥着关键作用。通过筛选多态性高的SSR引物，构建核桃品种的指纹图谱，实现对品种的