原创力文档- 1、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
- 4、该文档为VIP文档，如果想要下载，成为VIP会员后，下载免费。
- 5、成为VIP后，下载本文档将扣除1次下载权益。下载后，不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 6、成为VIP后，您将拥有八大权益，权益包括：VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 7、VIP文档为合作方或网友上传，每下载1次， 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等，对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
基因组数据分析技术创新与应用
目录
一、内容简述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3
1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3
1.2国内外研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
1.3研究内容与目标．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
二、基因组数据获取与预处理技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
2.1基因组测序技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
2.1.1第二代测序技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
2.1.2第三代测序技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
2.1.3第四代测序技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
2.2基因组数据质量评估．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20
2.3基因组数据预处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
2.3.1去除低质量读段．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
2.3.2读段比对．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
2.3.3基因组变异检测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
三、基因组数据分析算法创新．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
3.1序列比对算法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38
3.2变异检测算法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39
3.3基因组组装算法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43
3.4基因表达分析算法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45
3.5蛋白质组分析算法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47
四、基因组数据分析平台．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．50
4.1云计算平台．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51
4.2本地计算平台．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54
4.3软件工具介绍．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．55
五、基因组数据分析在医学领域的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．59
5.1慢性病研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．61
5.2肿瘤基因组学．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．64
5.3精准医疗．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．65
5.4出生缺陷诊断．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．67
5.5药物基因组学．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．68
六、基因组数据分析在农业领域的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．70
6.1作物遗传改良．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．72
6.2畜牧业遗传育种．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．74
6.3动植物疾病防控．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．77
七、基因组数据分析在生态领域的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．82
7.1物种进化研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．84
7.2生态系统多样性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．88
7.3环境污染监测．．．．．．．．．
文档评论（0）