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基因数据解读师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪种测序技术属于二代高通量测序的核心原理?
A.纳米孔单分子实时测序(纳米孔测序)
B.边合成边测序(Illumina测序)
C.双脱氧链终止法(Sanger测序)
D.焦磷酸测序(454测序)
答案:B
解析:二代测序(NGS)的核心是大规模平行测序,Illumina采用边合成边测序技术(通过荧光标记的dNTP和光学信号读取),是目前主流的NGS技术。A为三代测序技术,C为一代测序技术,D为已淘汰的二代早期技术。
以下哪项是衡量基因测序数据质量的关键指标(PHRED分数)?
A.Q20表示错误率1%
B.Q30表示错误率0.1%
C.Q40表示错误率0.01%
D.Q50表示错误率0.001%
答案:B
解析:PHRED质量分数计算公式为Q=-10×log??(P),其中P为碱基错误概率。Q30对应P=10?3(0.1%),Q20对应1%(A错误),Q40对应0.01%(C错误),Q50对应0.001%(D错误)。
根据ACMG(美国医学遗传学学会)指南,致病性变异的分类中,“可能致病(LikelyPathogenic)”需满足几项证据?
A.≥1项强证据(PVS1)
B.≥2项中等证据(PM)
C.1项强证据+1项中等证据
D.1项强证据+2项支持证据(PP)
答案:C
解析:ACMG将变异分为5类,“可能致病”需满足1项强证据(如功能丧失变异PVS1)+至少1项中等证据(如PM1-PM6)或多项支持证据(PP)。A为“致病(Pathogenic)”标准(≥1项强证据+其他支持),B、D表述不完整。
以下哪个数据库主要用于存储人群中变异的频率信息?
A.ClinVar
B.gnomAD
C.OMIM
D.HGMD
答案:B
解析:gnomAD(基因组聚集数据库)整合了大规模人群测序数据,提供变异的等位基因频率(AF);ClinVar(A)存储临床意义注释,OMIM(C)是孟德尔遗传病知识库,HGMD(D)是人类基因突变数据库(侧重致病突变)。
全外显子测序(WES)的主要局限性是?
A.无法检测拷贝数变异(CNV)
B.无法覆盖非编码区调控元件
C.测序深度低于全基因组测序(WGS)
D.不能识别插入缺失(InDel)
答案:B
解析:WES通过捕获外显子区域(占基因组约1-2%)进行测序,因此无法覆盖非编码区(如启动子、增强子);A错误,WES可通过深度分析间接检测CNV;C错误,WES测序深度通常高于WGS;D错误,WES能识别InDel。
在基因数据比对中,常用的短读长比对工具是?
A.BWA(Burrows-WheelerAligner)
B.GATK(GenomeAnalysisToolkit)
C.IGV(IntegrativeGenomicsViewer)
D.SAMtools
答案:A
解析:BWA是经典的短读长序列比对工具(基于Burrows-Wheeler变换);GATK(B)用于变异检测和质控,IGV(C)是可视化工具,SAMtools(D)用于SAM/BAM文件操作。
以下哪种变异类型最可能导致蛋白质功能完全丧失?
A.同义突变(SilentMutation)
B.错义突变(MissenseMutation)
C.无义突变(NonsenseMutation)
D.内含子剪接位点单碱基变异
答案:C
解析:无义突变会提前引入终止密码子,导致截断蛋白(功能丧失);同义突变(A)通常不改变氨基酸;错义突变(B)可能部分影响功能;剪接位点变异(D)可能导致外显子跳跃或异常剪接,但不一定完全失活。
在连锁不平衡(LD)分析中,r2值越接近1表示?
A.两个标记间的关联程度越低
B.两个标记间的重组率越高
C.两个标记间的等位基因频率差异越大
D.两个标记间的等位基因共分离程度越高
答案:D
解析:连锁不平衡(LD)的r2值反映两个SNP等位基因的共分离程度,r2=1表示完全连锁(等位基因完全共分离),r2=0表示完全独立。A、B、C均与LD定义相反。
RNA-seq数据中,FPKM(外显子每百万映射读数的千碱基片段数)主要用于衡量?
A.基因表达量
B.可变剪接事件
C.融合基因数量
D.转录本错误率
答案:A
解析:FPKM是标准化的基因表达量计算方法(校正测序深度和基因长度);可变剪接(B)需通过外显子跳跃等分析,融合基因(C)需特定算法检测,错误率(D)由测序质量控制。
基因数据解读中,“外显率(Penetrance)”指的是?
A.携带致病变异的个体表现出临床表型的比例
B.变异在人群中的发生频率
C.变异对蛋白质结构的影响程度
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