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生物信息分析师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪种文件格式用于存储带有质量值的原始测序数据?
A.FASTA
B.FASTQ
C.BAM
D.VCF
答案:B
解析:FASTA格式仅存储序列标识符和序列(无质量值);BAM是SAM的二进制压缩格式,用于存储比对后的序列;VCF用于存储变异信息。FASTQ是专门存储原始测序数据(序列+质量值)的标准格式。
短读长序列比对的常用工具是?
A.SPAdes
B.BWA
C.GATK
D.BLAST
答案:B
解析:SPAdes用于基因组组装;GATK用于变异检测;BLAST用于同源序列搜索。BWA(Burrows-WheelerAligner)是经典的短读长(如Illumina)比对工具。
以下哪项是基因本体(GO)注释的核心分类?
A.信号通路、代谢途径、细胞周期
B.分子功能、细胞组分、生物过程
C.编码序列、非编码RNA、调控元件
D.原核生物、真核生物、病毒
答案:B
解析:GO(GeneOntology)通过“分子功能(MolecularFunction)”“细胞组分(CellularComponent)”“生物过程(BiologicalProcess)”三个维度描述基因功能,其他选项为干扰项。
转录组测序(RNA-seq)的主要目的是?
A.检测基因组结构变异
B.分析基因表达水平
C.预测蛋白质三维结构
D.鉴定微生物物种组成
答案:B
解析:RNA-seq通过测序mRNA(或总RNA)定量基因表达量;基因组变异检测用全外显子/基因组测序;蛋白质结构预测用AlphaFold等工具;微生物鉴定用宏基因组测序。
评估基因组组装质量的关键指标是?
A.GC含量
B.N50长度
C.测序深度
D.错误率
答案:B
解析:N50是指将组装后的contig按长度排序后,累积长度达到总长度50%时对应的contig长度,数值越大组装连续性越好。其他选项为测序数据的基本属性,非组装质量核心指标。
以下哪个数据库是NCBI的核心核酸序列数据库?
A.UniProt
B.PDB
C.GenBank
D.KEGG
答案:C
解析:UniProt是蛋白质数据库;PDB是蛋白质结构数据库;KEGG是通路数据库。GenBank是NCBI维护的公开核酸序列数据库。
蛋白质序列同源性搜索的常用工具是?
A.ClustalW
B.BLASTp
C.HMMER
D.SAMtools
答案:B
解析:ClustalW用于多序列比对;HMMER基于隐马尔可夫模型搜索;SAMtools处理SAM/BAM文件。BLASTp(ProteinBLAST)专门用于蛋白质序列的同源性搜索。
差异表达基因分析的主流统计方法是?
A.DESeq2
B.BWA-MEM
C.GATKHaplotypeCaller
D.SPAdes
答案:A
解析:DESeq2是针对RNA-seq数据的差异表达分析工具,通过负二项分布模型校正测序深度和离散度。其他选项分别为比对、变异检测、组装工具。
宏基因组学研究的主要对象是?
A.单个物种的全基因组
B.环境中所有微生物的遗传物质
C.人类癌症组织的突变谱
D.模式生物的转录组
答案:B
解析:宏基因组(Metagenomics)直接测序环境样本(如肠道、土壤)中的所有微生物DNA,研究群落组成及功能,其他选项为单一物种或特定样本的研究。
以下哪种变异类型是基因组中最常见的?
A.插入缺失(Indel)
B.单核苷酸多态性(SNP)
C.拷贝数变异(CNV)
D.结构变异(SV)
答案:B
解析:SNP是单个核苷酸的变异,在人类基因组中每约1000个碱基出现一次,是最常见的变异类型;其他变异类型频率较低。
二、多项选择题(共10题,每题2分,共20分)
属于高通量测序技术的有?(至少2个正确选项)
A.Sanger测序
B.IlluminaHiSeq
C.PacBioSMRT
D.OxfordNanopore
答案:BCD
解析:Sanger是一代测序技术(低通量、长读长);Illumina(二代)、PacBio(三代)、Nanopore(三代)均为高通量测序技术。
支持VCF格式的生信工具有?(至少2个正确选项)
A.GATK
B.bcftools
C.FastQC
D.Bowtie2
答案:AB
解析:GATK(变异检测)和bcftools(VCF处理)支持VCF格式;FastQC用于质控(处理FASTQ);Bowtie2用于比对(处理FASTQ→SAM)。
基因组注释的主要内容包括?(至少2个正确选项)
A.基因结构预测(外显子、内含子)
B
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