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基因数据解读师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪种技术是当前基因数据解读中最常用的高通量测序方法?
A.Sanger测序
B.纳米孔测序(Nanopore)
C.边合成边测序(IlluminaNGS)
D.质谱测序(MALDI-TOF)
答案:C
解析:Illumina的边合成边测序技术(NGS)因通量高、成本低,是当前基因数据解读的主流技术。Sanger测序为一代测序,通量低;纳米孔测序虽长读长但误差率较高;质谱测序主要用于蛋白分析,故ABD错误。
根据ACMG指南,致病性变异(Pathogenic)的判定标准中,“人群数据库中该变异频率显著低于疾病预期发病率”属于以下哪类证据?
A.强证据(Strong,PVS1)
B.中等证据(Moderate,PM)
C.支持证据(Supporting,PP)
D.排除证据(Benign,BA/BP)
答案:B
解析:ACMG指南中,人群频率显著低于疾病发病率属于中等证据(PM2)。强证据(PVS1)通常指功能丧失变异(如无义突变);支持证据(PP)涉及功能研究等;排除证据用于良性变异判定,故ACD错误。
以下哪项是评估基因连锁分析结果的关键指标?
A.等位基因频率(MAF)
B.对数优势比(LOD值)
C.杂合度(Heterozygosity)
D.单倍型多样性(HaplotypeDiversity)
答案:B
解析:LOD值(对数优势比)是连锁分析中评估标记与疾病基因共分离概率的核心指标,≥3支持连锁,≤-2排除连锁。MAF是群体遗传学指标;杂合度和单倍型多样性用于遗传多样性分析,故ACD错误。
全外显子测序(WES)的主要局限性是?
A.无法检测拷贝数变异(CNV)
B.仅覆盖编码区(约1-2%基因组)
C.测序读长过短(100bp)
D.无法识别剪接位点变异
答案:B
解析:WES通过捕获外显子区域测序,仅覆盖约1-2%的基因组,无法检测非编码区变异。CNV可通过外显子覆盖深度分析检测;IlluminaNGS读长通常为150-300bp;剪接位点(如±2bp区域)在外显子捕获范围内可检测,故ACD错误。
基因数据质控中,“测序深度(Depth)”的定义是?
A.目标区域被测序覆盖的比例
B.每个碱基位置被测序的平均次数
C.测序数据中比对到参考基因组的比例
D.测序错误率(Q30值)
答案:B
解析:测序深度指目标区域每个碱基被测序的平均次数(如30X表示每个碱基平均被测30次)。覆盖度是区域被覆盖的比例;比对率是数据与参考基因组的匹配比例;Q30是错误率指标(错误率≤0.1%),故ACD错误。
以下哪种变异类型通常无法通过短读长NGS技术有效检测?
A.单核苷酸变异(SNV)
B.小插入缺失(Indel,50bp)
C.倒位(Inversion,1kb)
D.拷贝数变异(CNV)
答案:C
解析:短读长NGS(如Illumina)通过比对分析SNV、小Indel和CNV(基于覆盖深度),但倒位(染色体片段180°反转)需长读长或配对末端(Paired-end)的跨度异常检测,短读长难以有效识别,故C正确。
线粒体DNA(mtDNA)变异的遗传特点是?
A.遵循孟德尔显性遗传
B.仅通过父亲传递(父系遗传)
C.存在异质性(Heteroplasmy)
D.变异均导致严重表型
答案:C
解析:mtDNA变异通常存在异质性(同一细胞内野生型与突变型mtDNA共存),表型与突变比例相关。线粒体遗传为母系遗传(排除B);不遵循孟德尔定律(排除A);部分变异为良性或低penetrance(排除D)。
在肿瘤基因检测中,“驱动基因(DriverGene)”的核心特征是?
A.在肿瘤中高频突变(50%)
B.直接促进肿瘤发生发展的功能性变异
C.与肿瘤分期显著相关
D.仅存在于体细胞中
答案:B
解析:驱动基因指携带功能性变异(如激活突变、融合),直接促进肿瘤发生发展的基因(如EGFRL858R)。高频突变可能是乘客变异(如TP53在多种肿瘤高频但非驱动);与分期相关不一定是驱动;部分驱动基因(如BRCA1)也存在胚系变异,故ACD错误。
以下哪个数据库主要用于存储人类基因变异的临床意义?
A.dbSNP
B.gnomAD
C.ClinVar
D.ExAC
答案:C
解析:ClinVar是NCBI维护的变异临床意义数据库(致病/可能致病/意义未明等)。dbSNP存储所有已知SNV和Indel;gnomAD和ExAC(已整合入gnomAD)提供正常人群变异频率,故ABD错误。
生信分析中“去接头(AdapterTrimming)”的主要目的是?
A.去除低质量测序读段
B.消
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