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水稻苗期高温胁迫下编码基因与长链非编码RNA的协同响应机制解析

一、引言

1.1研究背景与意义

水稻（OryzasativaL.）作为全球最重要的粮食作物之一，为世界近一半人口提供主食，在保障全球粮食安全中占据着举足轻重的地位。然而，近年来，全球气候变暖的趋势日益显著，极端高温天气频繁出现，对水稻的生长发育、产量和品质造成了严重威胁。据相关研究表明，全球平均气温每升高1℃，水稻产量将减少6.6%-25%，且品质也会大幅下降。在水稻的生长周期中，苗期是其生长发育的关键阶段，对温度变化较为敏感。高温胁迫会干扰水稻苗期的正常生理代谢过程，影响其生长发育，进而对后期的产量和品质产生不利影响。例如，高温可能导致水稻苗期叶片光合作用降低，呼吸作用增强，物质运输与分配紊乱，从而使植株生长缓慢，分蘖减少，最终导致产量降低。此外，高温还可能影响水稻的品质，如使稻米的蛋白质含量降低，蒸煮品质和食用口感变差。

深入研究水稻苗期高温胁迫下的响应机制，挖掘相关的编码基因与长链非编码RNA（lncRNA），对于培育耐高温水稻品种，提高水稻在高温环境下的产量和品质，保障全球粮食安全具有至关重要的意义。通过揭示水稻在分子层面上对高温胁迫的响应机制，可以为水稻抗逆育种提供理论基础和基因资源，有助于开发新的育种策略和技术，培育出更适应未来气候变化的水稻新品种。这不仅能够减少高温对水稻生产的负面影响，确保粮食供应的稳定，还能为农业的可持续发展提供有力支持。

1.2国内外研究现状

在水稻耐热性研究方面，国内外学者已取得了一定的进展。研究发现，水稻在高温胁迫下会通过一系列生理生化变化来适应环境，如调节抗氧化酶系统活性、积累渗透调节物质等。在形态建成上，高温环境下水稻株高通常降低，叶片变小、颜色变深，分蘖数和穗数也会受到影响。在生理代谢方面，高温会导致水稻叶片光合作用降低，呼吸作用加速，能量消耗增加，物质运输与分配受阻，激素平衡改变。

在编码基因研究领域，众多与水稻耐热性相关的编码基因被陆续挖掘和鉴定。例如，华中农业大学李一博教授课题组克隆出调控品质耐高温的主效QTL基因QT12，该基因通过胚乳中的NF-YA8、NF-YB9与NF-YC10形成复合体，与QT12启动子的G/A变异结合，形成天然“双生锁”基因开关系统，调节储藏蛋白与淀粉合成，从而影响水稻的高温敏感性。福建农林大学许卫锋教授团队发现OsEIL5基因在水稻苗期和生殖期的耐热性调控中发挥重要作用，敲除OsEIL5后水稻耐热性显著降低，过表达则可增强高温抗性，且OsEIL5能直接激活下游蛋白磷酸酶编码基因OsPP91的表达。然而，目前对于这些编码基因之间的相互作用网络以及它们如何协同调控水稻耐热性的分子机制，仍有待进一步深入研究。

长链非编码RNA作为一类重要的调控分子，近年来在植物应对环境胁迫的研究中逐渐受到关注。在水稻中，已有研究揭示了一些lncRNA在抗病、抗逆等方面的作用机制。例如，中山大学生命科学学院陈月琴教授与广东省农业科学院于洋副研究员共同发表的研究，揭秘了长链非编码RNA（lncRNA）ALEX1在水稻抗病性中的新机制，ALEX1通过与生长素响应因子ARF3之间的直接分子相互作用，调控茉莉酸信号通路，从而增强水稻的免疫反应。但关于水稻苗期高温胁迫下lncRNA的研究还相对较少，其在高温响应过程中的调控作用和机制亟待深入探索。

1.3研究目标与内容

本研究旨在深入解析水稻苗期高温胁迫下编码基因与长链非编码RNA的响应机制，为培育耐高温水稻品种提供理论依据和基因资源。具体研究内容如下：

水稻苗期高温胁迫处理及表型鉴定：对水稻幼苗进行不同程度的高温胁迫处理，设置适宜的对照条件。观察并记录水稻幼苗在高温胁迫下的生长状况，包括株高、叶片形态、分蘖数等表型变化，为后续分子机制研究提供表型数据支持。

编码基因的筛选与功能分析：利用转录组测序技术，筛选出在水稻苗期高温胁迫下差异表达的编码基因。通过生物信息学分析，预测这些基因的功能和参与的代谢途径。采用基因编辑技术（如CRISPR/Cas9）对关键编码基因进行敲除或过表达，研究其对水稻苗期耐热性的影响，明确基因功能。

长链非编码RNA的鉴定与调控机制研究：运用高通量测序技术鉴定水稻苗期高温胁迫下差异表达的长链非编码RNA。通过RNA-FISH、RNA-pulldown、ChIP-seq等技术，研究lncRNA的亚细胞定位、与蛋白质或DNA的相互作用关系，解析其在高温胁迫响应中的调控机制。

编码基因与长链非编码RNA的互作网络构建：整合编码基因和长链非编码RNA的表达数据，利用生物信息学方法构建它们之间的互作网络。