辣椒SRO基因家族鉴定与组织特异性分析.pdfVIP

分子植物育种，2023年，第21卷，第14期，第4560-4567页

MolecularPlantBreeding,

,2023,Vol.21,No.14,4560-4567

研究报告

ResearchReport

辣椒SRO基因家族鉴定与组织特异性分析

党万玛！童

张永兰1货董莉莉！石天龙？引

张宇斌2.3

1

州师范大学生命科学学院，西南喀斯特山地生物多样性保护重点实验室，贵阳，550025

*通信作者,zhangyonglan2007@126.com

摘要大量研究表明，SROs与植物非生物胁迫和生长发育息息相关，具有PARP、RST和WWE3个特征

结构域。辣椒是人们日常食用的一类蔬菜，有必要研究其对非生物胁迫的耐受性以提高产量。基于辣椒已公

布的基因组数据，进行双向BLAST比对，获得5个辣椒SRO基因家族成员，分别为CaSRO1~CaSRO5。利用

NCBI-CDD工具进行基因结构分析表明，每个CaSRO基因含有4~6个外显子。组织特异性表达谱显示

CaSRO3和CaSRO4在辣椒的根、茎和叶3个不同组织中的表达存在差异，具有组织特异性。系统进化树分

析可以聚为2个亚类，T459_00928、T459_17068和T459_03742为第Ia类；T459_10290为第Ⅱb类。综合分

析5个辣椒SRO基因家族成员发现，T459_00928、T459_17068和T459_03742是辣椒应对非生物胁迫的重

要基因。本研究有助于揭示植物的基本生物学特性，为辣椒在非生物胁迫方面的研究提供一定的理论支持。

关键词辣椒；SRO；生物信息学

Genome-wideIdentificationandTissueSpecificAnalysisofSROGene

FamilyinCapsicumannuumL.

2

ZhangYonglan1*DangWanmaDongLili!ShiTianlongZhangYubin2.3

1DepartmentofBioengineering,QinghaiQaidamVocationalTechnicalCollege,Delhi,817000;2KeyLaboratoryofPlantPhysiologyandDevelop-

mentRegulation,SchoolofLifeScience,GuizhouNormalUniversity,Guiyang,550025;3KeyLaboratoryofStateForestryAdministrationonBiodi-

versityConservationinKarstMountainAreaofSouthwestofChina,SchoolofLifeScience,GuizhouNormalUniversity,Guiyang,550025

*Correspondingauthor,an2007@126.com

D0I::10.13271

1/imnh021.004560

AbstractAlargenumberofstudieshaveshownthatSROsarecloselyrelatedtoplantabioticstressandgrowth

anddevelopment,andhavethreecharacteristicdomains,namelyPARP,RSTandWWE.CapsicumannuumL.isa

typeofvegetablethatpeopleeateveryday,anditisnecessarytostudyitstolerancetoabioticstresstoincrease

yield.BasedonthepublishedgenomedataofC.annuumL.,atwo-wayBLASTcomparisonwasperformedto

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